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Estudos genômicos da expressão gênica global de Aspergillus niger crescido em bagaço e colmo de cana-de-açúcar

Processo: 13/09541-4
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Mestrado
Vigência (Início): 01 de agosto de 2013
Vigência (Término): 31 de julho de 2015
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
Pesquisador responsável:Fábio Márcio Squina
Beneficiário:Camila Cristina Sanchez
Instituição-sede: Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais (CNPEM). Ministério da Ciência, Tecnologia, Inovações e Comunicações (Brasil). Campinas , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:08/58037-9 - Geração de biblioteca para conversão enzimática de biomassa a partir de metagenoma do solo, AP.BIOEN.JP
Assunto(s):Análise de sequência de RNA   Transcriptoma   Biotecnologia   Bioetanol   Aspergillus niger

Resumo

A dependência de fontes de combustíveis fósseis, bem como a preocupação com o meio ambiente tem gerado mundialmente um grande interesse no desenvolvimento de outras fontes de energia. Neste sentido, o uso de etanol como combustível é vantajoso por se tratar de uma fonte inesgotável de energia, além de ser considerada de baixo impacto ambiental. Atualmente, através da fermentação do caldo da cana-de-açúcar, o Brasil é o segundo maior produtor de bioetanol. Entretanto, estudos sugerem que se forem utilizados o bagaço e a palha da cana, o Brasil pode dobrar sua produção, sem a necessidade do aumento de áreas cultiváveis. No entanto, o uso dessa biomassa apresenta como desafio a degradação da estrutura da parede celular vegetal formada por açúcares complexos, em açúcares mais simples, fermentáveis. Para isso, são necessários diversos tipos de enzimas hidrolíticas que são naturalmente produzidas por uma variedade de microrganismos; dentre eles destaca-se o fungo Aspergillus niger, capaz de produzi-las e secretá-las em grandes quantidades. Embora diversos estudos sejam realizados com este microrganismo, ainda não são conhecidos em detalhes seus mecanismos moleculares responsáveis pela degradação destes substratos. A proposta de mestrado em questão está inserida em um projeto que já está em andamento (Auxílio à Pesquisa Regular - 2011/08945-9), e tem como objetivo analisar a expressão gênica global de A. niger crescido em bagaço e colmo de cana-de-açúcar como fontes únicas de carbono pela técnica de sequenciamento high-throughput de RNA (RNA-Seq). Visa-se entender como esse fungo se comporta na degradação de substratos lignocelulósicos de interesse industrial para a produção de etanol de segunda geração. Esperamos identificar várias glicosil hidrolases e outras proteínas envolvidas direta ou indiretamente na sacarificação da biomassa, o que permitirá um melhor entendimento do processo de degradação de biomassas. Todo conhecimento em âmbito molecular resultante refletirá em novas perspectivas para o desenvolvimento de coquetéis enzimáticos mais eficazes e a custos mais baixos, que poderá possibilitar a produção de etanol de segunda geração em escala industrial. (AU)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
BORIN, GUSTAVO PAGOTTO; SANCHEZ, CAMILA CRISTINA; DE SANTANA, ELIANE SILVA; ZANINI, GUILHERME KEPPE; CORREA DOS SANTOS, RENATO AUGUSTO; PONTES, ANGELICA DE OLIVEIRA; DE SOUZA, ALINE TIEPPO; TAVARES SOARES DAL'MAS, ROBERTA MARIA MENEGALDO; RIANO-PACHON, DIEGO MAURICIO; GOLDMAN, GUSTAVO HENRIQUE; DE CASTRO OLIVEIRA, JULIANA VELASCO. Comparative transcriptome analysis reveals different strategies for degradation of steam-exploded sugarcane bagasse by Aspergillus niger and Trichoderma reesei. BMC Genomics, v. 18, JUN 30 2017. Citações Web of Science: 21.
BORIN, GUSTAVO PAGOTTO; SANCHEZ, CAMILA CRISTINA; DE SOUZA, AMANDA PEREIRA; DE SANTANA, ELIANE SILVA; DE SOUZA, ALINE TIEPPO; PAES LEME, ADRIANA FRANCO; SQUINA, FABIO MARCIO; BUCKERIDGE, MARCOS; GOLDMAN, GUSTAVO HENRIQUE; DE CASTRO OLIVEIRA, JULIANA VELASCO. Comparative Secretome Analysis of Trichoderma reesei and Aspergillus niger during Growth on Sugarcane Biomass. PLoS One, v. 10, n. 6 JUN 8 2015. Citações Web of Science: 40.
Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

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