Estudo de proteômica em pacientes com Sepse

• Processo: 13/15636-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 2013
• Data de Término da vigência: 31 de março de 2017
• Área de conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
• Pesquisador responsável: Reinaldo Salomão
• Beneficiário: Narendra Kumar Sharma
• Instituição Sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 11/20401-4 - Sepse: integrando a pesquisa básica e a investigação clínica II, AP.TEM
• Assunto(s): Infectologia Proteômica Inflamação Expressão gênica Sepse
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: expressão gênica | Inflamação | modulação de resposta inflamatória | proteômica | proteômica funcional | sepse | Infectologia

Resumo

Plano de trabalho de pós-doutorado:Estudo de proteômica em pacientes com SepseEstudos utilizando ferramentas de avaliação de expressão global gênica e, mais recentemente, proteica (genômica e proteômica) permitiram observar a complexidade da resposta imune na sepse e a necessidade de se utilizar essas ferramentas para uma melhor compreensão do fenômeno biológico (revisto em Salomão et al, Shock, 2012).Nesse contexto vamos dar continuidade aos estudos de expressão gênica e iniciar estudos de proteômica e lipidômica em nossos pacientes.O foco do estudo será a compreensão de mecanismos fisiopatológicos, podendo ou não evidenciar eventuais biomarcadores da sepse, novos ou já descritos.Estudos de proteômica serão iniciados em amostras de plasma de pacientes sépticos e controles sadios. Para evitar a influência de outras intervenções na resposta inflamatória dos pacientes, serão selecionados aqueles que desenvolveram infecção na comunidade e foram admitidos no hospital com sepse e cujas amostras de sangue foram obtidas nas primeiras 48 de admissão hospitalar.A ideia é fazer avaliação funcional, explorando vias de sinalização e redes de interação.O candidato selecionado tem o perfil para desenvolver esse trabalho, como mostra seu CV anexo e as publicações listadas abaixo. Os trabalhos serão conduzidos em colaboração com os Professores Drs Ismael Dale C. Guerreiro Silva (Departamento de Ginecologia, EPM, Unifesp) e Nilson Assunção (Instituto de Ciências Farmacêuticas, Químicas e Ambientais, Unifesp). Serão utilizados os laboratórios de imunologia da disciplina de infectologia (Dr. Reinaldo Salomão) e a Plataforma de Genômica e Proteômica da EPM-Unifesp, sob responsabilidade dos Profs Silva e Assunção, respectivamente.Lista de publicações do pesquisador de pós-doutorado: * Sharma NK, Sethy NK and Bhargava K. Comparative Proteome Analysis Reveals Differential Regulation of Glycolytic and Antioxidant Enzymes in Cortex and Hippocampus Exposed to Short-term Hypobaric Hypoxia. J Proteomics, 2013, 79: 277-298 * Sharma NK, Sethy NK, Meena RM, Ilavazhagan G, Das M and Bhargava K. Activity-dependent neuroprotective protein (ADNP)-derived peptide (NAP) ameliorates hypobaric hypoxia induced oxidative stress in rat brain. Peptides 32 (2011) 1217-1224 * Sharma NK, Sethy NK and Bhargava K. Proteomic Evaluation of Antioxidant Activities of NAP Peptide in Rat Brain Cortex Exposed to Chronic Hypobaric Hypoxia. J Proteins Proteomics (2013) 4 (1) : 39-50 * Ahmad Y, Shukla D , Garg I , Sharma NK , Saxena S, Malhotra VK & Bhargava K. Identification of Haptoglobin and Apolipoprotein A-I as Biomarkers for High Altitude Pulmonary Edema. Funct Integr Genomics (2011) 11:407-417 * Ahmad Y1 and Sharma N.1 An Effective Method for the Analysis of Human Plasma Proteome using Two- dimensional Gel Electrophoresis. J Proteomics Bioinform (2009) 2: 495-499 Manuscripts under communication and revision: * Ahmad Y1, Sharma NK1, Ahmad MF, Sharma M, Garg I, Qamar I and Bhargava K. Proteomic Analysis Reveals Differential Regulation of Plasma Proteins during Hypobaric hypoxia. BMC Genomics 2012 * Jain V, Sharma NK, Baitharu I, Prasad D, Singh SB, Ilavazhagan G. Neurobiology of Disease, 2013 Book Chapters * Sharma NK and Bhargava K. Phenomic and Genomic Tools for Analysis of livestock Genome, National Bureau of Animal Genetic Resources (ICAR), 2012; [Chapter 11:Proteomics and Its Application, pp 137-145]

Publicações científicas

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(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

SHARMA, NARENDRA KUMAR; FERREIRA, BIANCA LIMA; TASHIMA, ALEXANDRE KEIJI; COLO BRUNIALTI, MILENA KARINA; SOARES TORQUATO, RICARDO JOSE; BAFI, ANTONIO; ASSUNCAO, MURILLO; PONTES AZEVEDO, LUCIANO CESAR; SALOMAO, REINALDO. Lipid metabolism impairment in patients with sepsis secondary to hospital acquired pneumonia, a proteomic analysis. CLINICAL PROTEOMICS, v. 16, JUL 16 2019. (11/20401-4, 13/15636-8)

SHARMA, NARENDRA KUMAR; SALOMAO, REINALDO. SEPSIS THROUGH THE EYES OF PROTEOMICS: THE PROGRESS IN THE LAST DECADE. Shock, v. 47, n. 1, 1, p. 17-25, JAN 2017. (11/20401-4, 13/15636-8)

SHARMA, NARENDRA KUMAR; TASHIMA, ALEXANDRE KEIJI; COLO BRUNIALTI, MILENA KARINA; FERREIRA, EDEN RAMALHO; SOARES TORQUATO, RICARDO JOSE; MORTARA, RENATO ARRUDA; MACHADO, FLAVIA RIBEIRO; ASSUNCAO, MURILLO; RIGATO, OTELO; SALOMAO, REINALDO. Proteomic study revealed cellular assembly and lipid metabolism dysregulation in sepsis secondary to community-acquired pneumonia. SCIENTIFIC REPORTS, v. 7, NOV 15 2017. (11/20401-4, 13/15636-8)

SHARMA, NARENDRA KUMAR; SALOMAO, REINALDO. SEPSIS THROUGH THE EYES OF PROTEOMICS: THE PROGRESS IN THE LAST DECADE. Shock, v. 47, n. 1, p. 9-pg., 2017-01-01. (11/20401-4, 13/15636-8)