| Processo: | 13/26121-9 |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Mestrado |
| Data de Início da vigência: | 01 de março de 2014 |
| Data de Término da vigência: | 30 de junho de 2014 |
| Área de conhecimento: | Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos |
| Pesquisador responsável: | Luiz Lehmann Coutinho |
| Beneficiário: | Tassia Mangetti Gonçalves |
| Supervisor: | James M. Reecy |
| Instituição Sede: | Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil |
| Instituição Anfitriã: | Iowa State University, Estados Unidos |
| Vinculado à bolsa: | 12/23934-6 - Expressão diferencial de genes relacionados com maciez da carne em bovinos da raça nelore, BP.MS |
| Assunto(s): | Biologia computacional Biologia de sistemas Conectividade Expressão gênica diferencial Maciez da carne Gado Nelore |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | conectividade | Correlação | interações | rede | Bioinformática e biologia de sistemas |
Resumo Estudos de biologia de sistemas têm sido realizados em conjunto com a análise da expressão gênica para o aprofundamento das interações dinâmicas que ocorrem entre genes. O grande número de diferentes processos celulares pode estar recebendo uma abordagem reducionista por ter deficiências em análises que dificultam a interpretação de muitos genes e sua diferença na conectividade. Muitos pesquisadores têm desenvolvido programas que analisam redes complexas para uma melhor compreensão da biologia de sistemas. Para entender o processo biológico de maciez da carne, a análise integrativa é vantajosa para ajudar a desvendar a utilidade de todos os genes identificados na pesquisa. A proposta deste projeto é fazer uma abordagem de integração de redes que geram uma série de possíveis modelos que explicam a atividade de regulação da transcrição. Portanto, um dos métodos que serão utilizados é baseado no estudo de fatores de transcrição (FT), que desempenham um papel regulador importante no controle da expressão do genica, mostram a média absoluta da correlação da co-expressão de todos os genes. O algoritmo de fator de impacto regulatório (RIF) será utilizado para o estudo da ativação funcional dos FT. Outro método mais sensível que vai mostrar a diferença no comportamento ou co-expressão específica entre pares de genes e fará a quantificação de conectividade da expressão diferencial é o PCIT (Teoria da informação da correlação parcial). Também será analisada a importância de cada gene diferencialmente expresso no fenótipo na mudança do fator de impacto fenotípico (PIF). Todos estes estudos nos ajudará a elucidar o processo de maciez da carne. (AU) | |
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