Busca avançada
Ano de início
Entree

Busca por parceiros de interação do fator sigma ECF SigX de Pseudomonas aeruginosa

Processo: 15/17444-4
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
Data de Início da vigência: 01 de novembro de 2015
Data de Término da vigência: 31 de outubro de 2016
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Regina Lúcia Baldini
Beneficiário:Nathalia Caldeira Dias
Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Assunto(s):Genética   Fator sigma   Peptídeo hidrolases   Pseudomonas aeruginosa   Imunoprecipitação   Cromatografia a gás   Espectrometria de massas
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:fator sigma | protease | Pseudomonas aeruginosa | SigX | Genética e Biologia Molecular de Microorganismos

Resumo

Pseudomonas aeruginosa é uma gama-proteobactéria que geralmente habita água e solo, mas que pode infectar organismos filogeneticamente distantes. Sua versatilidade reflete uma maquinaria de regulação gênica muito sofisticada, que inclui fatores sigma, subunidades da RNA polimerase que reconhecem os promotores dos genes-alvo e são geralmente regulados por proteínas anti-sigma. Dentre os fatores sigma extracitoplasmáticos (ECF) existe SigX, que regula a síntese de ácidos graxos e genes relacionados ao metabolismo de c-di-GMP, e para o qual, até o presente momento, não foi encontrado um regulador. Uma das proteínas induzidas em condições em que SigX tem sua concentração diminuída é PA14_41730, uma proteína similar a RimK. O objetivo deste trabalho é analisar a relação entre SigX e as proteínas codificadas pelo operon PA14_41690, PA14_41710 e PA14_41730, além de buscar por outras proteínas que possam regular a função de SigX. Para tanto, dividiremos o trabalho em duas fases: a primeira consistirá em coexpressar as proteínas supracitadas e verificar sua interação com SigX por co-purificação de extratos de E. coli a partir de cromatografia de afinidade. Na segunda fase, His-FLAG-SigX será superexpresso em P. aeruginosa, e as técnicas de coimunoprecipitação e espectrometria de massa serão utilizadas para isolar e identificar proteínas que interajam com este fator sigma e que possam ter um papel na sua regulação.

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre a bolsa:
Mais itensMenos itens
Matéria(s) publicada(s) em Outras Mídias ( ):
Mais itensMenos itens
VEICULO: TITULO (DATA)
VEICULO: TITULO (DATA)