| Processo: | 16/06323-4 |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Doutorado |
| Data de Início da vigência: | 01 de outubro de 2016 |
| Data de Término da vigência: | 30 de abril de 2021 |
| Área de conhecimento: | Ciências Biológicas - Bioquímica - Bioquímica de Microorganismos |
| Pesquisador responsável: | María Eugenia Guazzaroni |
| Beneficiário: | Luana de Fátima Alves |
| Instituição Sede: | Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto (FFCLRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil |
| Vinculado ao auxílio: | 15/04309-1 - Novas abordagens para melhorar a prospecção funcional de biocatalizadores em bibliotecas metagenômicas, AP.JP |
| Bolsa(s) vinculada(s): | 18/16191-3 - Construção de novas cepas de Saccharomyces cerevisiae tolerantes a condições ácidas e inibidores advindos de pré-tratamento da biomassa, BE.EP.DR |
| Assunto(s): | Celulase Bioprospecção Metagenômica Biotecnologia Microbiologia ambiental |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | Bioprospecção | biotecnologia | Celulases | metagenômica | microbiologia ambiental | Regulação bacteriana | Metagenômica |
Resumo A conversão de biomassa lignocelulósica em combustíveis renováveis tem sido considerada uma alternativa promissora para a substituição de combustíveis fósseis derivados de fontes de energia não-renováveis. A lignocelulose consiste principalmente de celulose, hemicelulose e lignina, sendo a celulose o material mais recalcitrante dentro das paredes celulares das plantas, mas com grande potencial como fonte de produção de bioetanol. Atualmente, há uma crescente demanda por enzimas com melhor desempenho catalítico e que sejam tolerantes a parâmetros específicos de processos industriais. Neste contexto, a metagenômica permite identificar biocatalisadores com atividades específicas sem a necessidade de isolamento e cultivo de microorganismos em laboratório. Por exemplo, triagens funcionais identificaram novas enzimas e várias outras moléculas advindas de inúmeros ambientes. No entanto, algumas barreiras têm limitado a descoberta de novos genes através de abordagens metagenômicas. A probabilidade de identificação de um determinado gene depende de múltiplos fatores que estão intrinsecamente ligados. A eficiência da expressão heteróloga de um gene advindo do DNA metagenômico em um organismo hospedeiro substituinte e a utilização de vetores de clonagem não-otimizados para a construção das bibliotecas metagenômicas geralmente resultam em uma baixa taxa de identificação de enzimas. Segundo estudos, apenas 40% das atividades enzimáticas podem ser recuperadas a partir da clonagem aleatória em Escherichia coli, a bactéria mais comumente utilizada em triagens funcionais metagenômicas. Visando contornar essas barreiras impostas à identificação de novas enzimas a partir de bibliotecas metagenômicas, o presente projeto propõe (i) a construção de bibliotecas metagenômicas em vetores de ampla faixa de hospedeiros (broad-host-range vectors) (pSEVA) e (ii) a construção de um vetor pCELsyn, derivado de um vetor pSEVA e que contém a endoglucanase Cel5A de Bacillus subtilis, para expressão simultânea da endoglucanase Cel5A e das possíveis enzimas codificadas nos fragmentos metagênomicos, que serão inseridos em sequência ao gene da Cel5A, buscando aumentar a probabilidade de identificação de enzimas com atividades celulásicas. Os screenings serão realizados em hospedeiros distintos: E. coli e Pseudomonas putida, buscando vantagens na utilização de um segundo hospedeiro para o screening funcional, como já descrito por alguns estudos. As bibliotecas serão construídas a partir de amostras de solo com matéria-prima em decomposição e os screenings funcionais buscarão por atividades celulásicas através de metodologias de screening já bem estabelecidas pela literatura. Dessa forma, espera-se obter aumento da possibilidade de identificação de atividades celulásicas positivas. | |
| Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre a bolsa: | |
| Mais itensMenos itens | |
| TITULO | |
| Matéria(s) publicada(s) em Outras Mídias ( ): | |
| Mais itensMenos itens | |
| VEICULO: TITULO (DATA) | |
| VEICULO: TITULO (DATA) | |