Identificação de genes que modulam a relação genótipo-fenótipo em Saccharomyces cerevisiae.

• Processo: 16/21176-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
• Data de Início da vigência: 04 de fevereiro de 2017
• Data de Término da vigência: 03 de fevereiro de 2018
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Gonçalo Amarante Guimarães Pereira
• Beneficiário: Alessandro Luis Venega Coradini
• Supervisor: Ian Michael Ehrenreich
• Instituição Sede: Instituto de Biologia (IB). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: University of Southern California (USC), Estados Unidos
• Vinculado à bolsa: 14/26719-4 - Mapeamento e estudo de QTLs relacionados à robustez da levedura industrial Pedra-2 (Saccharomyces cerevisiae), BP.DR
• Assunto(s): Locos de características quantitativas
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioinformatic | Epistasis | Genetic background effects | modifier genes | quantitative trait loci | Biotecnology

Resumo

Evidências têm demonstrado que uma mesma mutação pode produzir diferentes fenótipos em indivíduos geneticamente distintos. Estes efeitos de background genético são causados por polimorfismos modificadores que segregam dentro das espécies e alteram os efeitos de mutações no genoma. Em um trabalho inédito, o grupo do Prof. Dr. Ehrenreich na Universidade do Sul da Califórnia mostrou que genes envolvidos na regulação da acetilação das histonas são particularmente propensos a mostrar efeitos de background. Estes genes desempenham um papel na regulação da cromatina e transcrição gênica, sendo altamente conservados de leveduras até os seres humanos. Assim, a utilização de leveduras para a compreensão dos efeitos de background genético pode lançar luz sobre como esses efeitos ocorrem em espécies de importância clínica e industrial. Durante a minha bolsa, no laboratório do Prof. Dr. Ehrenreich auxiliarei na caracterização das bases genéticas e moleculares dos efeitos de background genético decorrentes do processo de acetilação de histonas. Especificamente, irei utilizar a técnica high-throughput de engenharia genética CRISPR/Cas9 e métodos estatisticamente robustos de mapeamento genético para dissecar as bases genéticas dos efeitos de background genético na acetilação de histonas. Os resultados obtidos podem produzir novos conhecimentos fundamentais sobre os mecanismos que causam efeitos de background genético em eucariotos.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

LEE, JONATHAN T.; CORADINI, V, ALESSANDRO L.; SHEN, AMY; EHRENREICH, IAN M.. Layers of Cryptic Genetic Variation Underlie a Yeast Complex Trait. Genetics, v. 211, n. 4, p. 1469-1482, APR 2019. (16/21176-8)