Desenvolvimento de infraestrutura e ferramentas de análise e integração de dados de genômica e transcriptômica para Bothrops jararaca no projeto CeTICS

• Processo: 16/22415-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 2016
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2018
• Área de conhecimento: Interdisciplinar
• Pesquisador responsável: Hugo Aguirre Armelin
• Beneficiário: Henrique Cursino Vieira
• Instituição Sede: Instituto Butantan. Secretaria da Saúde (São Paulo - Estado). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 13/07467-1 - CeTICS - Centro de Toxinas, Imuno-Resposta e Sinalização Celular, AP.CEPID
• Assunto(s): Genomas Transcriptoma Biologia computacional Reconhecimento de padrões Expressão gênica Bothrops jararaca
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: expressão gênica | Genoma | meta-analises | Reconhecimento de Padrões | Transcriptoma | Bioinformática

Resumo

O projeto CeTICS tem como objetivo principal entender o comportamento dos sistemas biológicos baseado em análises de dados de larga escala e redes de sinalização, incluindo pesquisas em diversas áreas para estudar mecanismos bioquímicos, moleculares e celulares de toxinas que tem potencial terapêutico. O sequenciamento e estudo do genoma e transcriptoma da Bothrops jararaca são essenciais para tal entendimento e identificação de novas toxinas. Devido à grande complexidade do genoma da jararaca, torna-se importante o desenvolvimento de metodologias e ferramentas para a anotação estrutural e funcional do genoma com identificação de genes de interesse, de suas regiões promotoras e predição de motivos regulatórios, contribuindo para o estudo e avanço científico das toxinas em sistemas complexos. A posição envolverá o gerenciamento de grandes volumes de dados, e anotação interna e por bancos públicos em nosso servidor local, além da administração do servidor CeTICS e o auxílio no desenvolvimento de ferramentas para a plataforma CeTICSdb. Adicionalmente, o candidato trabalhará nas atividades para estudo do genoma e transcriptoma de Bothrops jararaca, como montagem, análise de expressão gênica, análises de enriquecimento e de vias. O candidato terá como tarefa a disseminação das ferramentas do grupo, com a criação de manuais de instrução, exemplos de treinamento e tutoriais. Ao final, esperamos ter uma plataforma de trabalho para compartilhar dados de Bothrops jararaca e outras espécies de interesse entre a comunidade científica. (AU)