| Processo: | 16/18294-9 |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Doutorado |
| Data de Início da vigência: | 01 de dezembro de 2016 |
| Data de Término da vigência: | 31 de dezembro de 2019 |
| Área de conhecimento: | Ciências Agrárias - Recursos Pesqueiros e Engenharia de Pesca - Aquicultura |
| Pesquisador responsável: | Diogo Teruo Hashimoto |
| Beneficiário: | Vito Antonio Mastrochirico Filho |
| Instituição Sede: | Centro de Aquicultura (CAUNESP). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil |
| Bolsa(s) vinculada(s): | 17/26900-9 - Caracterização genética de famílias de pacu (Piaractus mesopotamicus) resistentes à bactéria Aeromonas hydrophila por RNA-seq e RAD-seq, BE.EP.DR |
| Assunto(s): | Análise de sequência de RNA Peixes Transcriptoma Resistência à doença QTLs |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | disease resistance | fish | QTLs | RAD-seq | RNA-seq | transcriptome | Genética e Melhoramento Animal |
Resumo O melhoramento genético aplicado à aquicultura é uma área de pesquisa estratégica para o país, tendo em vista a indisponibilidade de peixes nativos melhorados. O presente estudo tem como objetivo fornecer subsídios para a seleção de genótipos de pacu Piaractus mesopotamicus resistentes á bactéria Aeromonas hydrophila. Os objetivos específicos são: 1) avaliação de parâmetros de genética quantitativa das famílias de pacu sujeitas ao desafio bacteriano de A. hydrophila; 2) caracterização de genes do sistema imune, por meio de sequenciamento RNA-seq, de indivíduos de pacu resistentes e susceptíveis ao desafio com A. hydrophila; 3) caracterização de QTLs (Quantitative Trait Locus) relacionados com resistência à A. hydrophila, por meio de sequenciamento/genotipagem de SNPs (ddRAD-seq, double-digest restriction site associated DNA sequencing). Para isto, pretende-se avaliar a herdabilidade de resistência a bactéria em um programa de melhoramento com cerca de 45 famílias de pacu sujeitas ao desafio com A. hydrophila, por meio da quantificação do tempo de morte e taxa de sobrevivência. Para o experimento de RNA-seq, após a inoculação de A. hydrophila, serão feitas as análises nos seguintes tempos: T1 (início da morte dos animais), peixes que apresentarem sinais de infecção, considerados como susceptíveis; T2 (após o plateau de mortalidade), exemplares considerados resistentes ao desafio; e em ambos T1 e T2, indivíduos dos tratamentos controles inoculados apenas com solução salina. Análises de bioinformática serão feitas a partir da montagem de novo do transcriptoma de pacu, comparando T1 x Controle, T2 x Controle e T1 x T2. Em seguida, será realizado o sequenciamento/genotipagem, por meio de ddRAD-deq (enzimas de restrição SphI e MluCI), para análise molecular de 10 famílias de pacu desafiadas com A. hydrophila, o que permitirá caracterizar QTLs e fornecer subsídios para seleção assistida por marcadores. O potencial impacto deste estudo é viabilizar tecnologias para produção de peixes diferenciados pela indústria da aquicultura. | |
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