Desenvolvimento de ferramentas e análises para estudo das bases moleculares para a replicação do DNA e ciclo celular

• Processo: 17/10853-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2017
• Data de Término da vigência: 31 de maio de 2018
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Maria Carolina Quartim Barbosa Elias Sabbaga
• Beneficiário: Davi Toshio Inada
• Instituição Sede: Instituto Butantan. São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 13/07467-1 - CeTICS - Centro de Toxinas, Imuno-Resposta e Sinalização Celular, AP.CEPID
• Assunto(s): Biologia computacional Sequenciamento de nova geração
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioinformática | Next Generation Sequencing | Bioinformática

Resumo

O projeto CeTICS tem como objetivo principal entender o comprtamento dos sistemas biológicos baseado em análises de dados de larga escala e redes de sinalização, incluindo pesquisas em diversas áreas para estudar mecanismos bioquímicos, moleculares e celulares de toxinas que tem potencial terapêutico. O seqüenciamento e estudo de regiões de interesse do genoma de Trypanosoma cruzi, como a identificação das origens de replicação e regiões de nucleossomo, durante a fase de síntese do ciclo celular, são essenciais para a elucidação das bases moleculares e celulares do controle da replicação do DNA e seus mecanismos moleculares. Ao contrário de outros eucariotos, os processos na replicação do DNA de parasitas importantes como os trypanosomas é pouco conhecido e torna-se importante o desenvolvimento de metodologias e ferramentas para análise e integração de dados de genomas, genes e dados de larga escala de ômicas para estudos das espécies de Trypanosomas e suas alternâncias entre os estágios replicativos e não replicativos do ciclo de vida, possibilitando a aplicação destas novas abordagens para análise em outras espécies e comparações entre espécies. Tem sido descrito na literatura que a origem da replicação em eucariotos estão localizadas em regiões não nucleossomicas. Deste modo, uma vez identificada as origens de replicação, um dos objejtivos será investigar como estas sequências estão organizadas, em relação à posição nucleossômica, em diferentes estágios do ciclo de vida do Trypanosoma. As sequências de DNA para estes estudos serão obtidas através de diferentes metodologias e técnicas como SMARD (single molecule analysis of replicated DNA) e ChIP assays (Chromatin Imuno-Precipitation).