Aplicação de instrumentos de bioinformática na avaliação de novas classes de antiretrovirais: antagonistas de ccr5 e inibidores de integrase

• Processo: 09/14215-3
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Vigência (Início): 01 de outubro de 2009
• Vigência (Término): 28 de fevereiro de 2011
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Jorge Simao do Rosario Casseb
• Beneficiário: Maira Luccia Martinez
• Instituição Sede: Instituto de Medicina Tropical de São Paulo (IMT). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 08/58138-0 - Aplicação de instrumentos de bioinformática na avaliação de novas classes de antiretrovirais: antagonistas de CCR5 e inibidores de integrase, AP.R
• Assunto(s): HIV-1 Biologia computacional Microbiologia aplicada Tropismo
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioinformática | Hiv-1 | Integrase | Tropismo | Microbiologia Aplicada

Resumo

A elucidação de muitas das etapas do ciclo de replicação do Vírus da Imunodeficiência Humana (HIV) e o desenvolvimento de novas tecnologias aplicadas a saúde propiciaram o desenvolvimento de novas estratégias para contornar as falhas terapêuticas. A disponibilização de novas drogas anti-retrovirais como os antagonistas de co-receptor e inibidores de integrase implica na seleção dos candidatos a utilizarem essas novas estratégias terapêuticas. Instrumentos de bioinformática podem representar uma alternativa mais acessível para a triagem dos pacientes, quando comparada aos ensaios atualmente estabelecidos. A partir de amostras de PBMCs de 100 pacientes soropositivos para HIV-1 e em acompanhamento clínico no Ambulatório de Imunodeficiências Secundárias - Departamento de Dermatologia (ADEE 3002)/HC-FMUSP, nosso estudo se propõe a identificar o padrão de uso dos co-receptores CCR5 e CXCR4 pelas cepas do HIV-1 utilizando um ensaio fenotípico comercial associado à análise do seqüenciamento da região V3 da gp120 do envelope do HIV-1 pelo uso de ferramentas de bioinformática e a verificação da presença de mutações capazes de conferir resistência ao uso de inibidores de integrase, através a análise do sequenciamento da região da integrase do HIV-1.