Homologia persistente e seus geradores aplicados no envelopamento de proteínas

• Processo: 18/20659-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de janeiro de 2019
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2019
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Matemática - Geometria e Topologia
• Pesquisador responsável: Marcio Fuzeto Gameiro
• Beneficiário: Carlos Henrique Venturi Ronchi
• Supervisor: Konstantin Mischaikow
• Instituição Sede: Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação (ICMC). Universidade de São Paulo (USP). São Carlos , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Rutgers The State University of New Jersey, New Brunswick, Estados Unidos
• Vinculado à bolsa: 17/14678-0 - Geradores de homologia persistente e aplicações, BP.MS
• Assunto(s): Homologia Topologia Proteínas Estabilidade proteica Aprendizado computacional
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Diagrama de Persistência | Envelopamento | Gerador de persistência | Homologia Persistente | proteína | Homologia persistente

Resumo

A homologia persistente é uma área em grande crescimento dentro da topologia computacional. Recentemente pesquisadores tem tentado aplicar estas novas ferramentas topológicas em problemas da vida real, desde ciência dos materiais até o estudo das proteínas. O problema de envelopamento das proteínas se trata de saber o quão estável uma proteína é sobre a proteólise, ou seja, quão facilmente uma proteína se quebra em aminoácidos ou polipeptídeos. A homologia persistente pode ser aplicada na sequência de carbonos de uma proteína, assim obtendo o diagrama de persistência, que nos dá a impressão topológica, uma informação topológica da proteína. O aprendizado de máquinas juntamente da homologia persistente é usado para determinar a estabilidade da proteína.