Prospecção do transcriptoma de células de camundongos infectados com Mycobacterium tuberculosis para validação de marcadores epigenéticos relacionados à proteção na Tuberculose

• Processo: 18/14968-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de novembro de 2018
• Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2021
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética
• Pesquisador responsável: Fabiani Gai Frantz
• Beneficiário: Felipe Teixeira Lima
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Assunto(s): Imunologia Epigênese genética Biologia computacional Biomarcadores Transcriptoma Enzimas Fígado Pulmão Tuberculose Mycobacterium tuberculosis
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioinformática | epigenética | genética | Imunologia | Saúde | Tuberculose | Imunologia/Epigenética

Resumo

A Tuberculose (TB) é uma das principais causas de morte por infecção bacteriana no mundo atualmente. Assim o desenvolvimento de alternativas para o combate de TB se faz necessário, e a compreensão de mecanismos de ação da resposta imune frente a infecção, em diversas situações, é base para uma possível solução. Na infecção experimental em camundongos suscetíveis, e na apresentação clínica extrapulmonar da TB, o bacilo dissemina-se para outros órgãos além do pulmão. Dentre os possíveis órgãos afetados, o fígado parece apresentar uma resposta bastante eficiente contra a infecção quando comparado ao pulmão e o baço, apresentando números de unidades formadoras de colônias de 1.000 a 10.000 vezes menor em relação ao pulmão. O fígado contém inúmeras células do sistema imune que se especializam na detecção, captura e defesa contra agentes patogênicos circulantes e os distinguem de antígenos tolerogênicos, como os provenientes da alimentação. Diante disso, nossa hipótese é que no fígado, determinadas vias de sinalização ou mecanismos efetores são bastante eficientes para o controle de infecções e poderiam não ser ativados nos órgãos onde o bacilo escapa do sistema imune. Assim, o transcriptoma de macrófagos do fígado e do pulmão foi realizado em trabalho anterior de nosso grupo de pesquisa, com o objetivo de identificarmos fatores que diferenciem a resposta imune em ambos os órgãos, de forma a permitir a disseminação do bacilo no pulmão, enquanto promovem o seu controle no fígado. Mecanismos de controle epigenético podem estar relacionados com mudanças pós-transcricionais que favorecem o crescimento do bacilo no hospedeiro suscetível ou, por outro lado que favoreçam o controle da doença nos indivíduos resistentes. Portanto, com este trabalho, nosso objetivo é analisar in silico os dados já obtidos do transcriptoma, em busca de genes que codificam enzimas epigenéticas diferencialmente expressas no fígado e pulmão. Estas enzimas podem inserir ou retirar grupamentos químicos do DNA ou de histonas e permitir que proteínas sejam ou não produzidas. Assim, uma vez detectadas quais enzimas estão associadas com a proteção ou susceptibilidade in silico, os alvos serão validados in vitro. Células provenientes do sangue periférico de doadores saudáveis serão infectadas in vitro com M. tuberculosis e serão tratadas com inibidores das enzimas. Após a inibição destas enzimas, a resposta imune e o crescimento bacteriano serão avaliado. Com isso poderemos identificar biomarcadores epigenéticos envolvidos na resposta contra TB em células humanas, afim de sugerir alvos específicos para fins terapêuticos. (AU)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

LIMA, Felipe Teixeira. Identificação de um novo conjunto de biomarcadores para predição do curso da infecção pelo Mycobacterium tuberculosis. 2021. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (PCARP/BC) Ribeirão Preto.