| Processo: | 19/00412-3 |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado |
| Data de Início da vigência: | 25 de março de 2019 |
| Data de Término da vigência: | 22 de março de 2020 |
| Área de conhecimento: | Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos |
| Pesquisador responsável: | Henrique Nunes de Oliveira |
| Beneficiário: | Andrea Renata da Silva Romero |
| Supervisor: | Cedric Gondro Msu |
| Instituição Sede: | Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (FCAV). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil |
| Instituição Anfitriã: | Michigan State University (MSU), Estados Unidos |
| Vinculado à bolsa: | 17/21000-0 - Estudos genômicos de resistência a Anaplasmose bovina em animais da raça Braford, BP.DR |
| Assunto(s): | Estudo de associação genômica ampla |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | babesiosis | Gwas | hemoparasites | Genômica animal |
Resumo Uma das dificuldades constantes na pecuária é o controle de parasitas tropicais, como o carrapato Rhipicephalus (Boophilus) microplus e os hemoparasitas por ele transmitidos, destacando-se a Babesia bigemina, protozoário causador de diversos prejuízos nos rebanhos. Assim, o objetivo do trabalho será realizar estudos de associação genômica ampla para a característica de nível de infecção por B. bigemina em bovinos da raça Braford. O grupo amostral será composto por 1600 animais da raça Braford e 100 Hereford, genotipados em painel Illumina BovineSNP50 BeadChip que passarão por um controle de qualidade para exclusão de marcadores e amostras problemáticos. O fenótipo será a quantificação dos níveis sanguíneos de B. bigemina estimados por meio da técnica quantitativa da reação em cadeia da polimerase (qPCR). As estimativas de composição genética, heterozigosidade a serem utilizadas nos modelos de análise, serão obtidas, a partir dos genótipos, pelo conjunto de softwares LAMP. Os fenótipos serão corrigidos para os efeitos sistemáticos utilizando o programa AIREMLF90 e posteriormente o GWAS será efetuado por meio do software GEMMA. As regiões indicadas pela análise de GWAS em associadas com a característica estudada serão pesquisadas nos bancos de dados Ensembl v.94 e CattleQTLdb r.36 para busca de genes e QTLs próximos aos SNPs associados. As buscas por interações genéticas que envolvam os genes apontados pelo GWAS e clusters relatados na literatura serão realizadas por meio do programa STRING v.10.5. Os resultados dos genes serão revisados de acordo com a literatura científica. | |
| Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre a bolsa: | |
| Mais itensMenos itens | |
| TITULO | |
| Matéria(s) publicada(s) em Outras Mídias ( ): | |
| Mais itensMenos itens | |
| VEICULO: TITULO (DATA) | |
| VEICULO: TITULO (DATA) | |