Reconstrução da complexidade da rede regulatória de Pseudomonas aeruginona

• Processo: 19/14883-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2019
• Data de Término da vigência: 29 de fevereiro de 2020
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia - Biologia e Fisiologia dos Microorganismos
• Pesquisador responsável: Rafael Silva Rocha
• Beneficiário: Bruno Rossi Carmo
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 12/22921-8 - Abordagens de biologia sintética para decifrar os mecanismos de integração de sinais em promotores bacterianos complexos, AP.JP
• Assunto(s): Biologia computacional Biologia de sistemas Banco de dados Genômica funcional Pseudomonas aeruginosa
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: biologia de sistemas | Genômica Funcional | Bioinformática

Resumo

Pseudomonas aeruginosa e uma bactéria frequentemente encontrada no ambiente e patógeno oportunista associada com infecções graves. Esse organismo possui um genoma de mais de 6 Mb o qual e controlado por uma sofisticada maquinaria molecular que inclui 25 fatores sigmas e centenas de fatores de transcrição. Embora muitos estudos tenham investigado diversos fatores de transcrição relacionados ao estilo de vida desse organismo, poucos trabalhos visam a reconstrução global da rede regulatória dessa bactéria. Dessa forma, o presente projeto visa investigar a rede global de P. aeruginosa mediante a integração de dados de larga escala disponível em bancos de dados especializados. Espera-se com essa abordagem um aumento no entendido dos mecanismos moleculares relacionados ao controle da expressão genica nessa bactéria.