Evolução de traços complexos: o exemplo do hábito alimentar em Calliphoridae

• Processo: 19/07285-7
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Vigência (Início): 01 de setembro de 2019
• Vigência (Término): 31 de agosto de 2021
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
• Pesquisador responsável: Tatiana Teixeira Torres
• Beneficiário: Sophie Hokulani Véronique Jessica Tandonnet
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Miíase Cochliomyia hominivorax Genômica comparativa
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Cochliomyia hominivorax | evolução do parasitismo | Evolução Experimental | genômica comparativa | Lucilia cuprina | miíase | Evolução do Parasitismo

Resumo

Este projeto tem como objetivo entender a evolução do parasitismo em moscas da família Calliphoridae, com representantes distribuídos mundialmente com status de praga. Os califorídeos formam uma família de moscas com hábitos alimentares diversos: necrofagia (alimentação das larvas por material em decomposição), parasitismo obrigatório (alimentação exclusiva das larvas por tecidos vivos) e parasitismo facultativo (estratégia generalista). Propomos estudar a evolução desses hábitos alimentares em diferentes níveis de complexidade: genoma, transcriptoma e fenótipo.Com dados genômicos e transcriptômicos para oito califorídeos e também para espécies próximas (e.g. mosca tsé-tsé), será realizada uma comparação global, focada em identificar quais genes, famílias e funções gênicas são importantes para os diferentes hábitos (e.g. taxa de evolução, regulação e expressão de genes, genes dieta-específicos).Numa abordagem complementar, propomos estudar a biologia de uma espécie parasita facultativa de grande interesse socioeconômico e sanitário, Lucilia cuprina. As larvas dessa espécie podem sobreviver numa dieta de tecido vivo (hábito parasita) ou de material em decomposição (hábito necrófago). Com a criação de linhagens de L. cuprina, selecionadas durante >10 gerações em meio parasita ou necrófago, propomos identificar os genes e polimorfismos necessários para a sobrevivência em cada dieta usando técnicas bioinformáticas (RNA-seq, DNA-seq) e edição de genes (CRISPR/Cas9). Ademais, documentaremos (pré- e pós-seleção) várias características relevantes da biologia das espécies (preferência de substrato, fecundidade, viabilidade, desenvolvimento).

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

TANDONNET, SOPHIE; KRSTICEVIC, FLAVIA; BASIKA, TATIANA; PAPATHANOS, PHILIPPOS A.; TORRES, TATIANA T.; SCOTT, MAXWELL J.. A chromosomal-scale reference genome of the New World Screwworm, Cochliomyia hominivorax. DNA Research, v. 30, n. 1, p. 9-pg., 2023-02-01. (19/10966-6, 20/05636-4, 19/07285-7)

DE LA ROSA, PABLO MANUEL GONZALEZ; THOMSON, MARIAN; TRIVEDI, URMI; TRACEY, ALAN; TANDONNET, SOPHIE; BLAXTER, MARK. A telomere-to-telomere assembly of Oscheius tipulae and the evolution of rhabditid nematode chromosomes. G3-GENES, GENOMES, GENETICS, v. 11, n. 1, JAN 2021. (19/07285-7)