Análise da distribuição do elemento de transposição SM1-alpha no genoma do parasita Schistosoma mansoni

• Processo: 19/16992-9
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2019
• Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2020
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Ricardo de Marco
• Beneficiário: João Paulo Cassucci dos Santos
• Instituição Sede: Instituto de Física de São Carlos (IFSC). Universidade de São Paulo (USP). São Carlos , SP, Brasil
• Assunto(s): Biologia computacional Genomas Transcrição genética Elementos de DNA transponíveis Schistosoma mansoni
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: elementos de transposição | Genoma | Schistosoma mansoni | Bioinformática

Resumo

O objetivo deste projeto é realizar uma análise da distribuição do elemento de transposição Sm1-alpha e avaliar seu impacto na evolução do genoma do parasita Schistosoma mansoni. Elementos de transposição (transposons) possuem a capacidade de replicação dentro dos genomas de seus hospedeiros e já foi demonstrado que possuem grande influência na evolução de genes e genomas. Os elementos Sm1-alpha possuem um grande número de cópias no genoma do Schistosoma mansoni, podendo contribuir consideravelmente em relação a estrutura gênica do parasito. Resultados preliminares nos mostram que os elementos de transposição tendem a ser encontrados em maiores números nas extremidades dos seus cromossomos. Além disso, análises das distâncias entre elementos vizinhos indicam a presença de configurações multiméricas destes transposons. Pretendemos avaliar se existe alguma influência dos níveis de transcrição dos genes no direcionamento da inserção destes elementos, visto que regiões de alta expressão tendem a possuir cromatina mais desempacotada, o que pode favorecer a inserção de elementos. Além disso, iremos avaliar o numero de copias deste elemento em outras espécies do gênero Schistosoma para avaliar se o alto número de cópias deste elemento deve-se a uma expansão recente.