Caracterização estrutural das proteínas do SARS-CoV-2, coronavírus causativo da doença infecciosa COVID-19, e busca por agentes antivirais

• Processo: 20/05330-2
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2020
• Data de Término da vigência: 21 de março de 2021
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
• Pesquisador responsável: Glaucius Oliva
• Beneficiário: Aline Minali Nakamura
• Instituição Sede: Instituto de Física de São Carlos (IFSC). Universidade de São Paulo (USP). São Carlos , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 20/04602-9 - Desenvolvimento de antivirais para o tratamento da COVID-19, AP.R
• Assunto(s): Biologia estrutural Infecções por Coronavirus COVID-19 SARS-CoV-2 Proteínas virais Replicação viral Planejamento de fármacos Desenvolvimento de fármacos Antivirais Terapia de alvo molecular Inibidores enzimáticos Pandemias
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Biologia Estrutural | clonagem e expressão recombinante de proteinas virais | desenvolvimento de inibidores específicos | ensaios enzimáticos e biofísicos | SARS-C0v-2 | triagem de compostos por ensaios de inibição enzimática | Biologia estrutural e desenvolvimento de fármacos

Resumo

Vírus emergentes e reincidentes sempre configurarão uma ameaça e um desafio à saúde pública global. O surgimento de um novo tipo de coronavírus (SARS-CoV-2) em dezembro de 2019 gerou uma epidemia que está em andamento resultando, até o momento, em mais de 227.000 casos e 9.000 mortes. Apesar dos esforços empregados com a atual epidemia e com os surtos passados (SARS e MERS) no desenvolvimento de antivirais, nenhum composto se mostrou eficiente em testes clínicos. Assim, este projeto tem como objetivo central utilizar as informações estruturais de proteínas de SARS-CoV-2 para auxiliar na busca por moléculas que possam auxiliar no desenvolvimento de fármacos antivirais específicos para esse vírus. Para isso, será conduzida a produção e caracterização de proteínas não estruturais (nsps) envolvidas no processo de replicação viral, como a protease Mpro nsp5, a RNA polimerase RdRp nsp12, a RNA helicase nsp13, a exoribonuclease nsp14 e a endoribonuclease nsp15. A partir dessas amostras, pretendemos utilizar uma combinação de técnicas biofísicas e bioquímicas para a identificação de novos candidatos a antivirais a partir do métodos de Planejamento de Ligantes Baseado na Estrutura dos Alvos (SBDD). Desta forma, pretendemos obter um potencial candidato a fármaco, que possa ser utilizado em testes pré-clínicos. Esse projeto está vinculado ao projeto 2020/04602-9 aprovado na chamada COVID-19 da FAPESP. (AU)