| Processo: | 20/01369-1 |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Doutorado |
| Data de Início da vigência: | 01 de agosto de 2021 |
| Data de Término da vigência: | 28 de fevereiro de 2025 |
| Área de conhecimento: | Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal |
| Pesquisador responsável: | Luciana Correia de Almeida Regitano |
| Beneficiário: | Jennifer Jessica Bruscadin |
| Instituição Sede: | Centro de Ciências Biológicas e da Saúde (CCBS). Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR). São Carlos , SP, Brasil |
| Vinculado ao auxílio: | 19/04089-2 - O Hologenoma de Nelore: implicações na qualidade de carne e em eficiência alimentar, AP.ESCIENCE.TEM |
| Bolsa(s) vinculada(s): | 22/12631-4 - Análise de mecanismos de regulação alelo-específicos a partir de dados de RNA-seq, ATAC-seq e ChIP-seq em músculo bovino, BE.EP.DR |
| Assunto(s): | Biologia computacional Qualidade da carne Gado Nelore Epigênese genética Genômica Melhoramento animal Imprinting genômico Estudo de associação genômica ampla |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | epigenética | Expressão alelo-específica | Genômica | melhoramento animal | Bioinformática |
Resumo O rebanho bovino brasileiro é composto majoritariamente por animais Nelore (Bos indicus), e seus cruzamentos. Embora sejam animais melhor adaptados ao clima tropical, apresentam carne com menos gordura intramuscular e menos macia em comparação aos animais de origem taurina. A expressão dos genes potencialmente associados à qualidade da carne bovina pode apresentar distorções em relação ao modelo aditivo, modelo universalmente adotado nas predições de valor genético dos animais, afetando a eficácia do processo de seleção. Quando um gene tem expressão alelo-específica (ASE, do inglês Allele-Specific Expression), a sua expressão é desbalanceada favorecendo um alelo e, se influenciada pelo efeito parental, ocorre o imprinting genômico. Mecanismos epigenéticos e cis-reguladores podem ser responsáveis por esses padrões quando o SNP regulador estiver em heterozigose. Assim, a fim de analisar a implicação da ASE sobre o melhoramento de Nelore, esse estudo irá associá-la diretamente aos fenótipos de qualidade de carne e avaliar o impacto do imprinting genômico, por meio da inclusão do efeito de origem parental nos modelos de análise de associação genômica global (Parent of Origin Genome Wide Association Studies- PO-GWAS), comparando aos resultados de GWAS obtidos sem a inclusão da origem parental do alelo. Esses dados serão integrados aos SNPs com ASE de uma população de bovinos da raça Limousin. Essa última abordagem visa analisar o quanto o padrão de expressão dessas variantes é conservado entre populações bovinas distintas. Os resultados contribuirão para a identificação de variantes reguladoras com potencial de aplicação ao melhoramento da qualidade da carne de Nelore. (AU) | |
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