Alterações transcriptômicas no pulmão em envelhecimento e sua relação com o Câncer de pulmão

• Processo: 21/05825-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2021
• Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2022
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
• Pesquisador responsável: Patricia Pintor dos Reis
• Beneficiário: Brunno Vivone Buquete Paiva
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina (FMB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
• Assunto(s): Biologia computacional Genética médica Neoplasias pulmonares Envelhecimento Transformação celular neoplásica Transcriptoma Processos biológicos Análise de sequência de RNA
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioinformática | câncer | Envelhecimento | pulmão | Transcriptoma | Bioinformática

Resumo

Durante o envelhecimento, o comprometimento morfofuncional do tecido pulmonar favorece o desenvolvimento de doenças crônicas, incluindo o câncer de pulmão (CP). No mundo e no Brasil, o CP é a neoplasia maligna de maior incidência e mortalidade em homens e mulheres. A relação entre o processo de envelhecimento pulmonar e o desenvolvimento de CP ainda não foi elucidada. Portanto, é necessária a realização de estudos que abordem o CP e sua interação com o envelhecimento. Neste estudo, propomos avaliar o perfil transcricional do pulmão em envelhecimento, comparando-o com o tipo mais prevalente de CP, o Carcinoma Pulmonar de Células Não Pequenas (CPCNP). Nosso objetivo será investigar os processos biológicos envolvidos no envelhecimento e no câncer e mapear as redes de interação gênica envolvidas, comuns e diferentes entre os dois processos (envelhecimento e câncer). As análises propostas utilizarão dados de sequenciamento do transcriptoma (RNA-Seq) de CPCNP, publicamente disponíveis no The Cancer Genome Atlas (TCGA)(https://portal.gdc.cancer.gov/) e dados de RNA-Seq de tecidos pulmonares normais disponíveis no Genotype-Tissue Expression (GTEx) database (https://gtexportal.org/home/). Os dados do GTEx abrangem tecidos pulmonares normais de indivíduos de diferentes faixas etárias: 20-29 anos (serão usados como controle) e 30-39, 40-49, 50-59, 60-69 e 70-79 (grupos de observação). Adicionalmente, será realizada validação dos resultados em outros bancos de dados. Para a validação, utilizaremos dados provenientes do Gene Expression Omnibus (GEO)(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/). A identificação das funções biológicas enriquecidas será realizada pelo uso da ferramenta de bioinformática EnrichR (https://maayanlab.cloud/Enrichr/). O projeto proposto deverá elucidar alterações transcriptômicas com papel biológico relacionado aos processos de envelhecimento do pulmão e carcinogênese pulmonar. (AU)