Análise genômica de bactérias probióticas bacteriocinogênicas: identificação taxonômica e caracterização de genes relacionados à síntese de bacteriocinas

• Processo: 21/12583-7
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 2021
• Data de Término da vigência: 22 de setembro de 2022
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Alessandro de Mello Varani
• Beneficiário: Lucas José Luduverio Pizauro
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (FCAV). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 18/25511-1 - Bioprospecção de bactérias probióticas bacteriocinogênicas: da otimização do cultivo à aplicação em sistemas de produção animal, AP.TEM
• Assunto(s): Genômica comparativa Biologia computacional Filogenia RNA ribossômico 16S Bacteriocinas Probióticos Análise de sequência de DNA Microbioma gastrointestinal Frangos de corte Suínos Peixes
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bacteriocinas | genômica comparativa | metagenômica | probioticos | Sequenciamento genomico | Genômica, Bioinformática, metagenômica

Resumo

Este estudo visa realizar a análise genômica de linhagens bacterianas probióticas produtoras de bacteriocinas, isoladas a partir de amostras da microbiota intestinal de frangos de corte (Gallus gallus domesticus) linhagem Cobb, suínos (Sus scrofa domesticus) mestiços das raças Landrace e Large white e peixes (Tilápia-do-Nilo, Oreochromis niloticus, e truta-arco-íris, Oncorhynchus mykiss). Para isso, serão realizados os seguintes objetivos especificos: (1) realizar o sequenciamento genomico após o isolamento e a caracterização fenotípica de linhagens de Bacilos acido lacticos (BALs) produtoras de bacteriocinas; (2) realizar a genomica comparativa pela análise filogenetica do 16S rRNA e do sequence type (MLST) obtidos in silico; (3) realizar a identificação de genes de bacteriocinas através do uso de diferentes bancos de dados e ferramentas de bioinformática como AntiSMASH, BACTIBASE, BAGEL , BOA e NeuBI. Espera-se descobrir novas variantes de bacteriocinas e sua respectiva associação com determinadas linhagens, espécies e nichos ecológicos. Uma vez que as linhagens estejam genomicamente caracterizadas, o projeto visa contribuir para o desenvolvimento racional de suplementações probióticas destinadas a animais de produção. (AU)