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Mecanismos moleculares envolvidos na sinalização celular e regulação gênica da assimilação de xilose em linhagens modificadas de Saccharomyces cerevisiae

Processo: 20/02936-7
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
Data de Início da vigência: 01 de janeiro de 2022
Data de Término da vigência: 31 de janeiro de 2025
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
Pesquisador responsável:Leandro Vieira dos Santos
Beneficiário:Gisele Cristina de Lima Palermo
Instituição Sede: Instituto de Biologia (IB). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):22/08092-0 - Elucidando o perfil de sinalização em linhagens industriais de S. cerevisiae e as convergências entre as vias de consumo de xilose para a conversão de resíduos agroindustriais, BE.EP.DD
Assunto(s):Fisiologia molecular   Transdução de sinais   Regulação da expressão gênica   Xilose   Saccharomyces cerevisiae   CRISPR-Cas9   Técnicas biossensoriais   Polimorfismo de um único nucleotídeo   Bioprodutos
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:biossensores | Saccharomyces cerevisae | sinalização celular | Xilose | Fisiologia molecular

Resumo

A atual matriz energética mundial utiliza como matéria prima os compostos fósseis, uma fonte finita e que gera grande preocupação ambiental devido as altas concentrações de gases de efeito estufa emitidas pelo seu uso. Biocombustíveis e bioquímicos produzidos a partir da biomassa (2G) são uma alternativa mais limpa provinda de fontes renováveis e necessários para atingir os objetivos globais de desenvolvimento sustentável. Um passo essencial no desenvolvimento de tecnologias 2G é o design e a construção de plataformas microbianas capazes de converter a totalidade dos açúcares da biomassa em bioprodutos. Apesar do desenvolvimento de linhagens modificadas da levedura Saccharomyces cerevisiae estar em andamento há duas décadas, as linhagens recombinantes atuais ainda fermentam o açúcar de cinco carbonos xilose (C5) em uma taxa muito menor que a glicose (C6). Recentemente, nosso grupo desenvolveu a primeira parte de um atlas genômico 2G como resultado do projeto FAPESP 2017/08519-6 que resultou na identificação de novas bases moleculares envolvidas no metabolismo e regulação do consumo de xilose. As modificações encontradas no projeto potencializam a conversão de xilose em bioprodutos pelas cepas construídas. Nesse contexto, a presente proposta visa o estudo e elucidação dos mecanismos moleculares que explicam como estas mutações alteram a sinalização celular e regulam o reconhecimento e a assimilação de xilose pelas linhagens mutantes desenvolvidas. Na primeira parte do projeto, será utilizado o sistema CRISPR/Cas9 para a validação dos SNPs envolvidos no metabolismo C5, bem como o estudo dos mecanismos moleculares envolvidos na fisiologia dos mutantes utilizando abordagens de multi-ômicas. As interações entre as diferentes vias metabólicas identificadas no projeto FAPESP 2017/08519-6 irão auxiliar a construir uma melhor compreensão do metabolismo C5 microbiano e da complexa rede de sinalização que regula a fermentação de açúcares C5. Na segunda parte do projeto, a partir de uma colaboração com a Lund University, a candidata fará um BEPE para a construção de um modelo in vivo de biossensores fluorescentes para monitoramento single-cell real-time das três principais vias de sinalização de açúcares em levedura. A plataforma criada será usada para investigar como as mutações identificadas alteram a sinalização celular e como a célula reconhece e assimila a xilose. As informações obtidas nesse projeto serão utilizadas no desenvolvimento racional e no melhoramento de plataformas microbianas visando a conversão mais eficiente de açúcares 2G em bioprodutos. (AU)

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
DOS SANTOS, LEANDRO VIEIRA; PALERMO, GISELE CRISTINA DE LIMA; COSTA, PAULO EMILIO DOS SANTOS; ALMEIDA, LUDIMILA DIAS; CARAZZOLLE, MARCELO FALSARELLA; PEREIRA, GONCALO AMARANTE GUIMARAES. Epistatic mutations in ISC metabolism synergize with cell cycle regulation and the PPP to enhance xylose fermentation and acetic acid tolerance in industrial yeast. Bioresource Technology, v. 439, p. 15-pg., . (20/07918-7, 20/02936-7, 19/06942-4, 17/08519-6)