Extração de Informações Biológicas de redes a partir de medidas topológicas

• Processo: 22/06218-7
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2022
• Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2023
• Área de conhecimento: Interdisciplinar
• Pesquisador responsável: Odemir Martinez Bruno
• Beneficiário: João Paulo Cassucci dos Santos
• Instituição Sede: Instituto de Física de São Carlos (IFSC). Universidade de São Paulo (USP). São Carlos , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 18/22214-6 - Rumo à convergência de tecnologias: de sensores e biossensores à visualização de informação e aprendizado de máquina para análise de dados em diagnóstico clínico, AP.TEM
• Assunto(s): Aspergillus fumigatus Inteligência artificial Redes biológicas
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Aspergillus fumigatus | Inteligência Artificial | Redes Biológicas | Ciência de Redes voltada para Biologia

Resumo

Este projeto tem como objetivo utilizar-se de redes metabólicas montadas a partir de experimentos de expressão genética de modo a obter possíveis vias metabólicas diferencialmente expressas com o intuito de melhor compreender o funcionamento do metabolismo do fungo Aspergillus fumigatus que tem adquirido resistência a fungicidas como Caspofungin. A montagem dos grafos se utilizará de algoritmos já descritos na literatura como válidos para a obtenção de vias metabólicas nos fungos. Será buscado padrões topológicos nestas redes que nos permita compreendê-las e classificá-las de acordo com suas funções biológicas.

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

SANTOS, João Paulo Cassucci dos. Biologia de sistemas e aprendizagem de máquina: novas aplicações de métodos computacionais. 2024. Dissertação de Mestrado - Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Física de São Carlos (IFSC/BT) São Carlos.