Determinação do regulon Zur em Chromobacterium violaceum

• Processo: 22/12782-2
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2022
• Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2024
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: José Freire da Silva Neto
• Beneficiário: Sergio Pereira Lima Neto
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 21/06894-0 - Fatores de transcrição bacterianos envolvidos em homeostase de metais, estresse oxidativo e virulência: investigando como Chromobacterium violaceum muda do ambiente para o hospedeiro, AP.JP2
• Assunto(s): Chromobacterium violaceum
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Análise do transcriptoma | Chromobacterium violaceum | Fator de transcrição bacteriano | Homeostase de zinco em bactérias | Regulação gênica em bactéria | Genética molecular de bactérias

Resumo

O metal de transição zinco é um micronutriente essencial para todos os organismos devido a sua função estrutural e catalítica em diversas proteínas. No entanto, o excesso de zinco causa intoxicação pela metalização incorreta de proteínas. O regulador de captação de zinco Zur (Zinc uptake regulator) controla a nível transcricional a homeostase do zinco em várias bactérias. A descoberta do repertório de genes regulados por Zur fornece novos insights sobre a homeostase do zinco. Determinamos anteriormente que no patógeno ambiental Chromobacterium violaceum Zur reprime um operon que codifica o sistema de captação de zinco ZnuABC, que é necessário para a virulência de C. violaceum. No entanto, o repertório global de genes de C. violaceum regulados por Zur ainda precisa ser definido. Neste trabalho, pretendemos definir o regulon Zur de C. violaceum por análise global do transcriptoma para identificar novos mecanismos de homeostase do zinco neste patógeno oportunista. Os genes regulados por Zur serão identificados por sequenciamento de RNA (RNA-seq) em C. violaceum selvagem e uma linhagem mutante zur. Ensaios de beta-galactosidase serão utilizados para validar os dados de RNA-seq. Os genes regulados diretamente por Zur serão definidos através da realização de ensaios EMSA. Genes selecionados do regulon de Zur serão caracterizados, inclusive por seu papel na virulência de C. violaceum. Uma compreensão mais ampla de como C. violaceum mantém homeostase de zinco poderá fornecer estratégias para lidar com patógenos oportunistas.