Arquitetura genética da resistência do feijoeiro ao nematóide de galhas Meloidogyne incognita: Construção de população F2, obtenção de mapa genético e mapeamento de QTLs

• Processo: 22/04061-3
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2022
• Data de Término da vigência: 16 de maio de 2023
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia
• Pesquisador responsável: Antonio Augusto Franco Garcia
• Beneficiário: Talissa de Oliveira Floriani Zimmermann de Souza
• Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 20/02755-2 - Resposta de acessos de feijoeiro ao nematoide de galhas Meloidogyne incognita: mapeamento de QLTs, perfil transcricional e estudo funcional de genes candidatos de resistência, AP.TEM
• Assunto(s): Phaseolus vulgaris Locos de características quantitativas
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Epistasia | Fitonematoides | Genotyping by Sequencing | Multiple Interval Mapping | Phaseolus vulgaris L | Qtl | Melhoramento genético do feijoeiro

Resumo

Os ataques por fitonematóides estão entre os principais problemas fitossanitários que acometem as lavouras de feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris L.). A produção de P. vulgaris no mundo pode ser desafiadora principalmente devido ao ataque do nematoide de galhas (Meloidogyne incognita). As alternativas de controle dos nematóides envolvem práticas inviáveis a campo, sendo uma das formas mais eficientes para o desenvolvimento de novas cultivares. Apesar dos avanços em genômica, pouco tem sido feito visando contribuir para o entendimento dos mecanismos envolvidos na resposta do feijoeiro aos nematoides de galhas. Neste cenário, o presente projeto pretende dar sequência aos esforços em parceria com o Programa de Melhoramento do Feijoeiro do IAC e do Departamento de Genética da ESALQ, especificamente no que se refere à arquitetura genética da característica envolvida na resposta do feijoeiro ao nematoide de galhas. Isso está sendo realizado no escopo do projeto temático número 2020/02755-2, e a presente proposta está em consonância com o projeto em andamento. Será utilizada uma população F2 contrastante para a resistência a M. incognita, oriunda do cruzamento entre os genitores PUEBLA-152 CIAT e JAMAPA-CNF-1761. A população será genotipada através da metodologia de GBS (Genotyping by Sequencing) com o intuito de aumentar o número de marcadores e explorar polimorfismos SNPs. Para a construção do mapa de ligação será utilizado o software OneMap. Com auxílio do software r/qtl será implementada a metodologia de mapeamento de múltiplos intervalos (Multiple Interval Mapping; MIM) para construção do mapeamento de QTL. A partir dos resultados deste projeto espera-se: entender a arquitetura genética da resistência ao nematoide; identificar número e posições dos QTLs, seus efeitos, bem como interações entre si (epistasia). O presente trabalho permitirá estudar a arquitetura genética da resistência ao nematoide, contribuindo para o desenvolvimento de estratégias de seleção assistida por marcadores moleculares e eventualmente estratégias para melhor identificação dos genes envolvidos no controle genético. Além disso, as mesmas características estão sendo estudadas em outras populações do mesmo projeto, assim os resultados aqui obtidos serão usados como forma de validação das regiões genômicas identificadas.

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

SOUZA, Talissa de Oliveira Floriani Zimmermann de. Arquitetura genética da resistência ao nematóide de galhas em feijoeiro comum. 2023. Dissertação de Mestrado - Universidade de São Paulo (USP). Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALA/BC) Piracicaba.