Organização de uma coleção de culturas de micro-organismos de mandioca e citros

• Processo: 23/03459-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de abril de 2023
• Data de Término da vigência: 29 de fevereiro de 2024
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
• Acordo de Cooperação: CONFAP - Conselho Nacional das Fundações Estaduais de Amparo à Pesquisa
• Pesquisador responsável: Welington Luiz de Araújo
• Beneficiário: Gabriele Muniz Costa
• Instituição Sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 22/10196-9 - Bactérias endofíticas associadas à Phytophthora spp. em citros e mandioca: diversidade e controle biológico, AP.R
• Assunto(s): Ecologia microbiana Diversidade microbiana Metagenômica Controle biológico Anti-infecciosos
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Antimicrobianos | biocontrole | diversidade microbiana | metagenômica | Ecologia Microbiana

Resumo

O gênero Phytophthora é um dos mais importantes entre os oomicetos fitopatogênicos, podendo infectar um grande número de espécies cultivadas de importância socio-econômica para a população mundial, assim como muitas plantas não cultivadas. Neste contexto, é relevante identificar a diversidade e variabilidade genética deste fitopatógenos isolado de diferentes plantas hospedeiras (em especial, citros e mandioca) e avaliar estratégias sustentáveis de controle deste fitopatógeno. Assim, considerando a interação entre a comunidade endofítica (em especial Burkholderia spp. e Methylobacterium spp.) com a planta hospedeira, e com patógenos associados, é possível identificar padrões desta comunidade que estejam associados à maior susceptibilidade da planta aos patógenos bem como identificar potenciais micro-organismos com potencial para o controle biológico. Dessa forma, na presente proposta o microbioma associado aos caules de citros e raízes de mandioca será caracterizado por métodos independentes de cultivo (diversidade taxonômica e funcional) e capacidade de Burkholderia spp. e Methylobacterium spp. em produzir compostos de interesse biotecnológico e inibir Phytophthora spp. será avaliada. Para isso, amostras de citros (especialmente no estado de São Paulo) e mandioca (especialmente no estado do Pará) serão coletadas de áreas com a presença ou não de gomose (citros) ou podridão radicular (mandioca) e a diversidade microbiana associada às plantas será avaliada. Além disso, isolados de Phytophthora spp. serão obtidos destas plantas e a diversidade e variabilidade genética avaliada por métodos moleculares, permitindo comparar a variação genética destes isolados obtidos nos dois estados e das duas espécies vegetais. A presente proposta visa alcançar um resultado ainda não descrito na literatura brasileira, descrevendo o microbioma de citros e mandioca e a sua interação com Phytophthora spp., além de permitir avaliar o risco de infecção cruzada de mandioca para citros e vice-versa e propor modelos de controle biológico deste fitopatógeno. (AU)