Estudos estruturais e funcionais de uma proteína hipotética de ligação a ácidos graxos em Leishmania amazonensis

• Processo: 23/02831-9
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2023
• Data de Término da vigência: 31 de maio de 2027
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Química de Macromoléculas
• Pesquisador responsável: Roberto Kopke Salinas
• Beneficiário: Lucas Felipe Almeida Athayde
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Proteína 9 associada à CRISPR Repetições palindrômicas curtas agrupadas e regularmente espaçadas Cristalografia Leishmania Ressonância magnética nuclear Química de proteínas
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Cas9 | Crispr | Cristalografia | Fabp | leishmania | Rmn | Química de Proteinas

Resumo

As leishmanioses são uma classe de doenças tropicais negligenciadas causadas por diferentes espécies do gênero Leishmania, da família Trypanosomatidae. A proteína hipotética codificada pelo gene LmxM.34.3070 foi identificada pela primeira vez em Leishmania mexicana. Predições de estrutura de LmxM.34.3070 por diferentes métodos (PHYRE2, RaptorX e AlphaFold) apontaram a presença de um domínio estruturalmente semelhante às proteínas de ligação de ácidos graxos (FABP). Esses resultados sugerem que LmxM.34.3070 pode estar associado ao metabolismo de lipídios e ácidos graxos, essencial para a sobrevivência de Leishmania no ambiente do hospedeiro. Buscas por sequências semelhantes a LmxM.34.3070 demonstraram que esse gene é conservado em outros tripanossomatídeos. Neste projeto iremos caracterizar a função biológica deste gene pela análise fenotípica de linhagens nocaute de LmxM.34.3070 em Leishmania amazonensis obtidos pela técnica CRISPR/Cas9. Propomos também resolver a estrutura experimental do domínio FABP-like usando uma combinação de RMN com cristalografia de raios-X, e identificar o seu possível ligante. Esperamos que a combinação de abordagens de biologia celular e biologia estrutural nos permita descobrir a função biológica de LmxM.34.3070 e seu papel no metabolismo de ácidos graxos de Leishmania.