Caracterização genômica de porcinos e linhagens celulares suínas: genotipagem dos haplótipos do sistema de antígeno leucocitário suíno (SLA), tipagem sanguínea e detecção do número de cópias e expressão gênica dos retrovírus endógenos suínos (PERVs)

• Processo: 23/11936-9
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2023
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2025
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
• Pesquisador responsável: Silvano Mario Attilio Raia
• Beneficiário: Giovanna Cantini Tolezano
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina (FM). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 21/11872-5 - Centro de Ciência para o Desenvolvimento em Xenotransplante, AP.CCD
• Assunto(s): Expressão gênica Sequenciamento Suínos
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: expressão gênica | sequenciamento | Suínos | xenotransplante | Xenotransplante

Resumo

Técnicas de engenharia genética voltadas ao xenotransplante humano vêm se tornando cada vez mais robustas com os aprimoramentos metodológicos decorrentes de anos de pesquisas na área (Eisenson et al., 2022). Neste contexto, porcos são considerados os melhores animais para a doação de órgãos, dadas as similaridadesanatômicas e fisiológicas com o ser humano e a facilidade e curto tempo de reprodução da espécie (Stewart et al., 2022). No entanto, para o estabelecimento de linhagens celulares suínas knock-out e knock-in para genes de interesse visando contornar as barreiras imunológicas interespécies e que, posteriormente, possam ser utilizadas para a transferência nuclear de células somáticas objetivando obter embriões geneticamente modificados, é necessário conhecer a priori a composição genômica dos suínos doadores de material biológico. A tipagem sanguínea dos porcos e a detecção do número de cópias e expressão gênica dos retrovírus endógenos suínos (porcine endogenous retroviruses, PERVs) são etapas cruciais de triagem: enquanto que apenas suínos com o tipo sanguíneo "0" do sistema A0 são viáveis para o xenotransplante (Smood et al., 2019), PERVs representamuma classe de retrovírus endógenos integrados em diferentes números de cópias ao genoma suíno a depender de sua idade, espécie e tecido analisado (Semaan et al., 2013); é de interesse buscar animais que apresentem menor número de cópias e menor expressão gênica dos PERVs. Adicionalmente, estando estabelecidas diferenteslinhagens celulares suínas editadas com tipo sanguíneo "0" e baixo número de cópias e expressão de PERVs, a genotipagem do sistema de antígeno leucocitário suíno (swine leukocyte antigen, SLA) permite conhecer os haplótipos presentes nos animais utilizados e a melhor escolha em futuros ensaios clínicos de xenotransplante(Sørensen et al., 2017). Com base no exposto, este trabalho caracterizará os genótipos SLA, o tipo sanguíneo e o número de cópias e expressão gênica de PERVs de porcinos e linhagens celulares utilizados nas pesquisas desenvolvidas no âmbito do projeto "Centro de Ciência para o Desenvolvimento em Xenotransplante".