Bioinformática na análise filogenética, filogeográfica e epidemiológica na evolução dos vírus Influenza no Brasil

• Processo: 23/15913-3
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 2023
• Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2024
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Maria Carolina Quartim Barbosa Elias Sabbaga
• Beneficiário: Iago Trezena Tavares de Lima
• Instituição Sede: Instituto Butantan. Secretaria da Saúde (São Paulo - Estado). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 21/11944-6 - Contínuo aprimoramento de vacinas: Centro para Vigilância Viral e Avaliação Sorológica (CeVIVAS), AP.CCD
• Assunto(s): Influenza Biologia computacional
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Influenza | Bioinformatica

Resumo

A geração de grande volume de dados moleculares com o sequenciamento de nova geração tornou a preparação de conjuntos de dados e análises posteriores desafiadora, e a bioinformática tem se mostrado aliada para contornar esses desafios. Conceitualmente, a bioinformática é uma subdisciplina da biologia e da informática que se encarrega da aquisição, armazenamento, análise e difusão de dados biológicos. No contexto do projeto CeVIVAS, em que o principal objetivo é o entendimento da capacidade de dispersão de linhagens dos vírus Influenza no Brasil, a geração de dados moleculares é massiva e como consequência há necessidade de tratamento desses dados. O tratamento dos dados moleculares e automação será feito por meio de geração de scripts em linguagem de programação bash e Python. As análises filogenéticas e filogeográficas, métodos importantes para avaliar a seleção natural na evolução dos vírus, velocidade e a dinâmica de transmissão, exigem conjuntos de dados e pipelines específicos para serem executadas. Os metadados, um conjunto de dados que provêem uma descrição concisa a respeito dos dados, serão manipulados usando a linguagem R, para extrair informações relevantes no contexto epidemiológico.