Sequenciamento de última geração: estudo in silico do microbioma, resistoma e mobiloma da lesão periapical.

• Processo: 23/14724-2
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 20 de janeiro de 2024
• Data de Término da vigência: 19 de março de 2024
• Área de conhecimento: Ciências da Saúde - Odontologia - Endodontia
• Pesquisador responsável: Brenda Paula Figueiredo de Almeida Gomes
• Beneficiário: Juliana Delatorre Bronzato
• Supervisor: Tsute Chen
• Instituição Sede: Faculdade de Odontologia de Piracicaba (FOP). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Piracicaba , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Forsyth Institute, Estados Unidos
• Vinculado à bolsa: 17/25090-3 - Análise do conteúdo microbiológico e da família fadA presentes em canais radiculares e lesões periapicais de dentes com infecção secundária e sua relação com os níveis de citocinas pró-inflamatórias e MMPs, BP.PD
• Assunto(s): Microbiologia Sequenciamento de nucleotídeos em larga escala
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Endodontia | Microbiologia | Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala | Microbiologia Endodôntica

Resumo

Pouco se sabe sobre a microbiota, o resistoma e o mobiloma das lesões periapicais. Este estudo tem como objetivo coletar todos os dados disponíveis do sequenciamento de próxima geração de lesões periapicais de origem endodôntica, analisá-los in silico quanto à diversidade taxonômica e filogenética, realizar um estudo funcional da comunidade microbiana e avaliar o mobiloma e o resistoma usando ferramentas de bioinformática. Para isso, serão pesquisadas bases de dados online em busca de sequências provenientes de sequenciamento de última geração de lesões periapicais. As sequências obtidas serão analisadas com base no seu tipo, seja amplicon ou metagenômico, após avaliação de sua qualidade. As sequências de amplicons serão avaliadas quanto à diversidade taxonômica e filogenética e predição funcional da comunidade microbiana. Sequências metagenômicas serão investigadas para avaliação da microbiota juntamente com prospecção genética para avaliação do mobiloma e resistoma. Diversos genes podem potencialmente conferir resistência a antibióticos, e a compreensão do mobiloma e do resistoma nas lesões periapicais conferirá um novo olhar ao tratamento desta doença.