Montagem e anotação dos genomas de Calliphoridae

• Processo: 23/14660-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 2023
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2024
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
• Acordo de Cooperação: NSF - Dimensions of Biodiversity e BIOTA
• Pesquisador responsável: Tatiana Teixeira Torres
• Beneficiário: Vanessa Araujo Soares da Cunha
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 20/05636-4 - Dimensions US-BIOTA-São Paulo: além da aparência: compreendendo as origens evolutivas e genéticas de diversas especializações tróficas em moscas varejeiras, AP.BTA.TEM
• Assunto(s): Genômica comparativa Hábitos alimentares Parasitismo Evolução
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Evolução Experimental | genômica comparativa | hábitos alimentares | moscas varejeiras | Parasitismo | Evolução

Resumo

A existência de espécies relacionadas e com hábitos alimentares contrastantes na família Calliphoridae a torna um grupo ideal para o estudo da evolução de especializações tróficas. O estudo da relação entre diversidade genômica e variação fenotípica (diferentes preferências alimentares) pode ser realizado por meio da genômica comparativa. No projeto temático ao qual este processo está associado, "Dimensions US-BIOTA-São Paulo: More to the blow fly than meets the eye - understanding evolutionary and genetic origins of diverse trophic specializations", faremos uma comparação de genomas de pelo menos 14 espécies de Calliphoridae com diferentes hábitos alimentares. Destas espécies, iremos sequenciar, montar e anotar os genomas de oito espécies. O bolsista será responsável pela montagem e anotação desses genomas, e pela preparação e submissão dos dados a bancos de dados públicos. Como parte do projeto colaborativo, também investigaremos o hábito facultativo de Lucilia cuprina por meio de experimentos de seleção artificial seguidos de sequenciamento. O bolsista também auxiliará na criação de linhagens de L. cuprina que se desenvolverão (e evoluirão), ao longo de várias gerações (20-30), em substrato em decomposição ou fresco, e sequenciará o genoma completo das linhagens de L. cuprina em três momentos distintos.