Novas metodologias de fenotipagem de populações de feijoeiro em resposta a Meloidogyne incognita: uso de PCR quantitativo associado a índices de avaliação nematológica

• Processo: 23/14857-2
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de fevereiro de 2024
• Data de Término da vigência: 31 de janeiro de 2026
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia - Fitossanidade
• Pesquisador responsável: Maria Lúcia Carneiro Vieira
• Beneficiário: Líllian Beatriz Januário Bibiano
• Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 20/02755-2 - Resposta de acessos de feijoeiro ao nematoide de galhas Meloidogyne incognita: mapeamento de QLTs, perfil transcricional e estudo funcional de genes candidatos de resistência, AP.TEM
• Assunto(s): Fenotipagem Phaseolus vulgaris Reação em cadeia da polimerase via transcriptase reversa quantitativa (qRT-PCR)
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Fenotipagem | Nematóide das galhas | Phaseolus vulgaris | qPCR | Resistência a Patógenos | Genética molecular, nematologia

Resumo

O uso de cultivares resistentes é o método ideal para o controle de nematoides fitoparasitas. Apesar de se reproduzirem assexuadamente, existe variabilidade genética entre os isolados de M. incognita, já que diferentes isolados mostram padrões distintos de compatibilidade com os hospedeiros, podendo levar à quebra da resistência. A técnica de fenotipagem é crucial na avaliação de genótipos resistentes a nematoides, e a capacidade de quantificar a infestação por esses parasitas é um pré-requisito para a adoção de medidas de controle mais eficazes. Dentre as principais metodologias em nematologia destaca-se o fator de reprodução (FR= PF/PI), uma medida entre a população final (PF) e a população inicial ou inoculada (PI) de nematoides, sendo considerada um dos melhores índices para avaliar a resistência de cultivares. Outros parâmetros como índice de galhas (IG) e o índice de massa de ovos (IMO) são variáveis importantes e usados para auxiliar na interpretação dos valores de FR. A fenotipagem é igualmente essencial quando se busca associar genótipo a fenótipo com o objetivo de mapear locos quantitativos (QTLs) associados à resistência. Em experimentos anteriores, nosso grupo usou a fenotipagem por IG e número de massas de ovos na busca por regiões genômicas associadas à resistência quantitativa. Como resultado, quatro QTLs foram identificados controlando a formação de galhas, porém nenhum QTL foi identificado associado ao fenótipo número de massas de ovos. Neste contexto, o uso de abordagens mais sensíveis, como a fenotipagem molecular baseadas em PCR quantitativo (qPCR), pode levar à detecção de outros QTLs. Apesar da disponibilidade de protocolos moleculares para identificação de M. incognita, nenhum desses métodos foi desenvolvido no intuito de quantificar o nematoide para avaliação de genótipos de feijoeiro quanto à resistência. Para seleção eficiente de genótipos resistentes, torna-se essencial validar uma metodologia de quantificação do patógeno associada aos parâmetros usuais de avaliação nematológica. Neste contexto, a bolsista de pós-doutorado será responsável por coordenar os experimentos de fenotipagem das RILs derivadas do cruzamento biparental 'IAC-Tybatã' x 'Branquinho', bem como pelas etapas envolvidas na associação entre métodos de avaliação da resistência, quais sejam, FR, IG, IMO, número de nematoides/grama de raiz e a quantificação molecular por qPCR.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

ORSI, NICOLE; MARQUES, JOAO PAULO RODRIGUES; BIBIANO, LILLIAN BEATRIZ JANUARIO; CAMARGO, LUIS EDUARDO ARANHA; PINHEIRO, DANIEL GUARIZ; VIEIRA, MARIA LUCIA CARNEIRO. Genotype-Specific Responses of Common Bean to Meloidogyne incognita. PHYTOPATHOLOGY, v. 115, n. 5, p. 13-pg., 2025-05-27. (20/02755-2, 23/14857-2)