| Processo: | 24/00964-4 |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Doutorado |
| Data de Início da vigência: | 01 de agosto de 2024 |
| Situação: | Interrompido |
| Área de conhecimento: | Ciências Agrárias - Medicina Veterinária - Clínica e Cirurgia Animal |
| Pesquisador responsável: | Alexandre Secorun Borges |
| Beneficiário: | Fabricio Moreira Cerri |
| Instituição Sede: | Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia (FMVZ). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil |
| Bolsa(s) vinculada(s): | 25/02776-3 - Sequenciamento de Genoma Completo de isolados de Clostridioides difficile recuperados de equinos para determinação de fatores de virulência e genes de resistência antimicrobiana, BE.EP.DR |
| Assunto(s): | Diarreia Enterite Equinos Potros |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | Diarréia | enterite | equinos | potros | Clínica Medica de Grandes Animais |
Resumo Clostridioides difficile é importante agente etiológico da diarreia em potros e se constitui em importante problema para outros animais e humanos. Esta bactéria anaerobica possui genes de virulência responsáveis pela sua toxigencidade, adesão, motilidade, esporulação e resistência à antimicrobianos. Existem poucos estudos que determinaram a importância desses para o desenvolvimento da diarreia em potros e a relação dos isolados com aquele obtidos de outros animais, humanos e meio ambiente. O objetivo deste projeto é realizar a determinação dos genes de virulência e resistência a antimicrobianos e nível de similaridade entre os isolados de C. difficile obtidos de potros (com e sem diarreia). As amostras utilizadas no projeto serão provenientes de um banco de amostras de fezes de potros (com e sem diarreia) e amostras de fezes a serem colhidas de potros de haras da região de Botucatu com histórico de diarreia e submetidas a isolamento de C. difficile. A colheita destas novas amostras ocorrerá até que a obtenção de 50 isolados toxigênicos estejam disponíveis para sequenciamento de genoma completo (SGC). O isolamento bacteriano será realizado a partir inoculação em meio não seletivo suplementado com tauracolato de sódio, seguido por choque com álcool e semeados em placas de ágar C. difficile Moxalactam Norfloxacin (CDMN) incubadas em condições de anaerobiose. Posteriormente, será extraído o DNA bacteriano das colônias de C. difficile. A multiplex PCR será realizada para detecção dos genes 16s RNA (constituinte), tcdA, tcdB, cdtA e cdtB, ribotipagem e teste de susceptibilidade a antimicrobiano. Serão preparadas bibliotecas de DNA para SGC (plataforma Illumina), montagem de contigs e determinação do MLST. Será realizada a determinação dos genes de virulência e resistência a antimicrobianos e alinhamento das sequências genética com isolados já descritos na literatura. Este projeto irá gerar dados que irão auxiliar na compreensão da epidemiologia do C. difficile em potros e sua importância na saúde única. | |
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