Desenvolvimento de Ferramenta Computacional para Auxílio ao Projeto de Automatização em Biodescoberta Microbiana

• Processo: 24/14211-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2024
• Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2026
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação - Sistemas de Computação
• Pesquisador responsável: Solange Oliveira Rezende
• Beneficiário: Diego Minatel
• Instituição Sede: Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação (ICMC). Universidade de São Paulo (USP). São Carlos , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 19/17721-9 - A função da Química na adaptação de holobiontes, AP.TEM
• Assunto(s): Banco de dados Segurança da informação Sistemas de informação Desenvolvimento web
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Banco de dados | Desenvolvimento Full-Stack | Seguranca da Informacao | Sistemas de Informação | Desenvolvimento Web

Resumo

O candidato atuará como desenvolvedor full stack no Laboratório de Inteligência Computacional (LABIC) do Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação (ICMC) da USP/São Carlos, implementando soluções digitais para uma variedade de necessidades e problemas oriundos do subprojeto "Automatização em Biodescoberta Microbiana". Sua principal atividade residirá na implementação e documentação de um protótipo de sistema computacional, baseado em inteligência artificial, que visa possibilitar aos usuários capturar, anotar, armazenar, recuperar e reconhecer microrganismos a partir de imagens de culturas em placas de Petri. Tal sistema foi idealizado e modelado pelo pós-doutorando Antonio Rafael Sabino Parmezan, que começou seu desenvolvimento no segundo semestre de 2022 e o integrou com um banco de dados de imagens microbianas que vem sendo construído de modo pioneiro no referido subprojeto. Para impulsionar o desenvolvimento do protótipo, o candidato dará prosseguimento à implementação dos módulos de (i) gerenciamento de pesquisadores, (ii) gerenciamento de microrganismos, (iii) monitoramento da qualidade de dados, (iv) recuperação de imagens microbianas, e (v) identificação de microrganismos a partir de imagens de culturas, recebendo orientação e suporte do Dr. Antonio Rafael Sabino Parmezan ao longo do processo. Outras atividades planejadas incluem a manutenção do servidor que atualmente hospeda a aplicação, a instalação e configuração de GPUs, e a formatação de máquinas Linux/Windows. (AU)