Análise do impacto evolutivo de retrocópias de genes codificadores no filo Chordata.

• Processo: 24/13830-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de janeiro de 2025
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2026
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética
• Pesquisador responsável: Pedro Alexandre Favoretto Galante
• Beneficiário: Lorraine Christine de Oliveira
• Instituição Sede: Hospital Sírio-Libanês. Sociedade Beneficente de Senhoras (SBSHSL). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Biologia computacional Chordata Evolução Expressão
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioinformática | Chordata | Evolução | expressão | Ortologia | Retrocópia | Bioinformática

Resumo

Retrocópias são cópias de RNA mensageiro processados que se originam através do mecanismo de transcrição reversa mediado por proteínas codificadas a partir de elementos LINE-1. As retrocópias foram primeiramente identificadas na década de 1980 em humanos e subsequentemente em diversas outras espécies, de forma que são consideradas um evento recorrente durante a evolução de mamíferos. O sequenciamento completo do Genoma Humano nos anos 2000 e o subsequente avanço nas metodologias de sequenciamento e montagem de genomas de diversos organismos, assim como o aprimoramento dos algoritmos/pipeline computacionais para o processamento destes dados, permitiu a busca sistemática de eventos estruturais complexos, incluindo eventos de retrocópias. Neste projeto objetivamos uma análise aprofundada e sistemática de diversos aspectos de retrocópias de 44 espécies, incluindo 13 primatas, 4 roedores, 12 outros mamíferos, 14 outros vertebrados e um invertebrado. Neste trabalho iremos investigar de forma sistemática a ortologia e a expressão de retrocópias nessas espécies, o que deve nos permitir traçar a história evolutiva ainda original e completa das retrocópias e identificar aquelas com potenciais ganhos de novas funcionalidades resultantes das duplicatas gênicas. Como resultado final, acreditamos que essa análise ampla, porém profunda e sistemática das retrocópias em 44 espécies resultará em uma compreensão original, completa e aprofundada de como essas duplicatas gênicas contribuem para a origem de novidades genéticas de maneira espécie-específica e também dentro de cada ordem taxonômica, informações ainda inéditas na literatura.