Seleção Natural no Gênero Cereus Mill. (Cactaceae; Cereeae): Uma Abordagem de Mapeamento Genômico com Sequenciamento de Baixa Cobertura

• Processo: 24/23123-5
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de maio de 2025
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2027
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
• Pesquisador responsável: Fernando de Faria Franco
• Beneficiário: Matheus Vieira da Silva
• Instituição Sede: Centro de Ciências Humanas e Biológicas (CCHB). Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR). Sorocaba , SP, Brasil
• Assunto(s): Adaptação Evolução molecular Testes de seleção
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: adaptação | evolução molecular | Testes de Seleção | Genética Evolutiva

Resumo

Compreender o processo de adaptação é fundamental na biologia evolutiva. Neste projeto, serão utilizadas estatísticas para identificar assinaturas de seleção natural em espécies da família Cactaceae, mais especificamente do gênero Cereus Mill, que é amplamente distribuído na região Neotropical. Reconstruções biogeográficas sugerem que, em parte, transições biogeográficas estão associadas à transição de nicho, o que sugere importante papel da seleção natural nos processos de diversificação do gênero. O objetivo dessa proposta é identificar assinatura de seleção natural, em clados específicos de Cereus, em genes do metabolismo que possam contribuir para o entendimento dos processos de colonização de novos biomas e diversificação no gênero. Para tanto, um conjunto de dados de sequenciamento do genoma de baixa cobertura representativos de clados-alvo de Cereus será usada, permitindo a montagem dos genomas nucleares parciais e plastomas, anotação de regiões codificantes e não codificantes, identificação de genes anotados, testes de seleção natural baseados em aceleração de taxas de evolução em regiões não gênicas, na razão entre taxas de substituição não sinônimas e sinônimas (dN/dS) para regiões gênicas, e identificação de anotação funcional dos genes sob seleção positiva.