Caracterização molecular e epigenética de cromossomos em anel: Investigação dos mecanismos de formação e do efeito de posição por meio do perfil de metilação de DNA e expressão gênica

• Processo: 25/05729-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2025
• Data de Término da vigência: 31 de março de 2027
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
• Pesquisador responsável: Maria Isabel de Souza Aranha Melaragno
• Beneficiário: Gabriella Rodrigues dos Santos
• Instituição Sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 19/21644-0 - Impacto de variantes genéticas na estabilidade do genoma e seus efeitos no fenótipo, AP.TEM
• Assunto(s): Epigenômica Expressão gênica Fenótipo Metilação de DNA Citogenômica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: cromossomo em anel | epigenética | expressão gênica | fenótipo | Metilação do DNA | Sequenciamento por leituras longas | Citogenomica

Resumo

Os cromossomos em anel, em geral, se formam por quebras e fusões dos braços cromossômicos havendo perda de material genético em ambas as extremidades. Essas quebras e fusões ocorrem predominantemente em regiões altamente repetitivas, dificultando a identificação precisa dos pontos de junção e dos mecanismos de formação, bem como o impacto funcional dos anéis no genoma. A replicação dos cromossomos em anel pode levar à formação de alterações secundárias, contribuindo para um mosaicismo dinâmico. Além disso, a estrutura circular do cromossomo em anel pode ter um efeito de posição, afetando a regulação epigenética com alterações na metilação e na expressão de genes, tanto próximos aos pontos de quebra quanto em regiões mais distantes. O presente projeto propõe o estudo de cerca de oito pacientes com cromossomos autossomos em anel. Será realizado o cariótipo para constatar a presença do cromossomo em anel e avaliar sua instabilidade em culturas de linfócitos. Abordagens de investigações inovadoras, incluindo sequenciamento completo do genoma por meio de leituras longas (Long-Read Sequencing) e ferramentas de bioinformática, serão aplicadas para caracterizar os cromossomos em anel quanto ao conteúdo genômico, definir os pontos de quebra e inferir seus mecanismos de formação. Essa técnica também permite a investigação da metilação de DNA alelo-específica, comparando o cromossomo em anel com seu homólogo normal. Os genes encontrados diferencialmente metilados serão analisados quanto à expressão gênica, por meio de RT-qPCR. Este estudo visa aprimorar o entendimento das respostas do genoma a alterações estruturais, com implicações científicas e clínicas, especialmente no prognóstico e no aconselhamento genético.