Investigação da etiologia genética em pacientes com hipótese diagnóstica de microdeleção/microduplicação

• Processo: 24/22499-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 2025
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2028
• Área de conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
• Pesquisador responsável: Maria Isabel de Souza Aranha Melaragno
• Beneficiário: Henrique Garcia Silveira
• Instituição Sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 19/21644-0 - Impacto de variantes genéticas na estabilidade do genoma e seus efeitos no fenótipo, AP.TEM
• Assunto(s): Diagnóstico Fenótipo Análise de sequência de DNA Análise de sequência de RNA Genética médica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: diagnóstico | fenótipo | linhagens celulares linfoblastoides | Microdeleções | Sequenciamento de DNA | sequenciamento de RNA | Genética Médica

Resumo

As síndromes causadas por alterações no número de cópias (CNVs) são caracterizadas pela presença de microdeleções ou microduplicações em segmentos genômicos. Essas alterações podem ser identificadas por técnicas de citogênomica, como MLPA e análise cromossômica por microarray (CMA), que detectam desequilíbrios genômicos associados a diferentes síndromes. No entanto, alguns indivíduos com os principais sinais clínicos de síndromes relacionadas a CNVs apresentam resultados citogenômicos normais. Quando os testes moleculares convencionais não indicam alterações, a investigação pode ser ampliada utilizando sequenciamento completo do exoma (WES), com o objetivo de identificar variantes gênicas patogênicas associadas ao fenótipo observado. Durante o projeto de Mestrado do aluno, foram selecionados 40 pacientes com suspeita de microdeleções, dos quais 31 apresentaram resultados normais por técnicas citogenômicas. Em 13 pacientes, o WES revelou variantes gênicas associadas a síndromes com alta sobreposição fenotípica com as condições inicialmente suspeitadas. Em destaque, entre cinco pacientes com suspeita de síndrome de deleção 22q11.2, dois foram diagnosticados com a síndrome de Wiedemann-Steiner e três com a de Rubinstein-Taybi. Um paciente com suspeita de síndrome de Rubinstein-Taybi foi diagnosticado com a de Wiedemann-Steiner. Além das análises comparativas dos fenótipos de cada síndrome, com o objetivo de propor diagnósticos diferenciais, o projeto de Doutorado ampliará as abordagens de estudo. Será investigado se há sobreposição nos mecanismos de patogenicidade das síndromes por meio do estudo das vias de sinalização pelo sequenciamento de RNA (RNA-seq) e utilizando linhagens celulares linfoblastoides. Além disso, para os 18 casos negativos pelo WES, propõe-se a utilização da plataforma GestaltMatcher e do sequenciamento completo do genoma (WGS) em associação com o RNA-seq, os quais possuem maior capacidade de investigação de variantes e expressão gênica. Dessa forma, a integração dessas estratégias não só beneficiará os pacientes com a obtenção dos diagnósticos clínicos, mas também impulsionará a compreensão das bases genéticas de doenças raras, com efeito positivo para os pacientes, familiares, profissionais da saúde e pesquisadores, além de contribuir para o avanço do conhecimento científico e por uma formação abrangente do aluno.