Avaliação da estratégia de PCR-shotgun no sequenciamento de um genoma completo, tendo como modelo um plasmídeo bacteriano

• Processo: 99/06030-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 1999
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2001
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Emmanuel Dias-Neto
• Beneficiário: Ricardo Gabriel Mattos
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina (FM). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Análise de sequência de DNA Genomas Xylella fastidiosa
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Genoma | Pcr Baixa Estrigencia | Sequenciamento | Xylella Fastidiosa

Resumo

O projeto propõe avaliar o uso de PCR em baixa estringência com iniciadores aleatórios, na geração de moléculas molde úteis em projetos genoma. Neste estudo, o DNA de Xylella fastidiosa será amplificado sob condições de baixa estringência e os padrões de amplificação obtidos serão clonados e sequenciados. As seqüências serão analisadas e comparadas à seqüências de X. fastidiosa já existentes. Resultados preliminares indicam o potencial do método no auxílio de fechamento de GAPs além de uma distribuição dos fragmentos obtidos ao longo de todo o genoma. (AU)