Identificacao computacional de lipoproteinas em espiroquetas.

• Processo: 01/08133-2
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2001
• Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2003
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação
• Pesquisador responsável: João Carlos Setubal
• Beneficiário: Marcelo da Silva Reis
• Instituição Sede: Instituto de Computação (IC). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Assunto(s): Genética Biologia computacional Sistemas de informação Projeto genoma Biologia
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Bioinformatica | Biologia | Genetica | Projeto Genoma | Projeto Transcriptoma | Sistema De Informacao

Resumo

O candidato a esta bolsa tem por objetivos: (1) aprender e fixar os conceitos e ferramentas básicas de bioinformática para projetos genoma e transcriptoma (linguagens de programação utilizadas, pacotes, conceitos biológicos de base, etc...) (2) desenvolvimento de ferramentas e sistemas de informação de auxílio aos projetos genoma e transcriptoma em andamento no LBI: genomas e transcriptomas do programa AEG (Agronomic and Environmental Genomes - genomas Xylella - uva, amêndoa e espirradeira - Leifsonia xyli subsp. xyli, Leptospira interrogans e EST de eucalipto), anotação dos genomas da Xanthomonas (citri e campestres), bem como EST de Schistosoma mansoni (anotação) e EST de cana- de-açúcar e EST de Gracilaria (em cooperação com Instituto de Botânica da USP) (3) especificamente, o candidato deverá se responsabilizar, sob coordenação do orientador, do tratamento de ESTs de Gracilaria, sequenciadas pela Botânica da USP, sob responsabilidade da Profa. Mariana Oliveira. (AU)