Análise e Identificação de Redes Gênicas por meio de Técnicas de Análise de Sistemas Complexos e Teoria da Informação

• Processo: 08/03052-3
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2008
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2011
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação
• Pesquisador responsável: Roberto Marcondes Cesar Junior
• Beneficiário: Evaldo Araújo de Oliveira Filho
• Instituição Sede: Instituto de Matemática e Estatística (IME). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 05/00587-5 - Modelagem por redes (grafos) e técnicas de reconhecimento de padrões: estrutura, dinâmica e aplicações, AP.TEM
• Assunto(s): Biologia computacional Teoria da informação
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Análise de padrões | bioinformática | Redes de regulação gênica | teoria da informação | Bioinformática

Resumo

O objetivo do projeto é o estudo numérico das séries temporais referentes às medidas de expressão gênica em bioinformática, utilizando técnicas oriundas da Teoria do Caos, Física Estatística e Teoria da Informação. Em particular, estamos interessados em caracterizar a dinâmica dessas séries e fornecer novas medidas para a identificação de redes gênicas. A idéia é partir da análise padrão de séries temporais (retornos, sazonalidade, ...) e seguir pela análise do regime dinâmico (magnitude do comportamento caótico) para caracterização das medidas de expressão gênica. As informações adquiridas nessa etapa serão utilizadas na identificação de redes gênicas por meio de métodos naturais da Física Estatística (Sistemas Complexos) e Teoria da Informação.Além disso, também objetivamos o desenvolvimento profissional do bolsista envolvido, não apenas devido às publicações e possíveis patentes resultantes ou colaborações científicas. O fortalecimento profissional do bolsista será feito por meio da criação e ministração de cursos sobre Bioinformática, envolvendo os métodos estudados e criados, bem como pela orientação de estudantes em programas de iniciação científica e mestrado.