Redes complexas aplicadas à genética e à biologia do desenvolvimento

• Processo: 06/61232-2
• Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Vigência (Início): 01 de junho de 2007
• Vigência (Término): 31 de maio de 2009
• Área do conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação - Metodologia e Técnicas da Computação
• Pesquisador responsável: Luciano da Fontoura Costa
• Beneficiário: Alexandre dos Santos Cristino
• Instituição-sede: Instituto de Física de São Carlos (IFSC). Universidade de São Paulo (USP). São Carlos , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 05/03926-5 - Genômica funcional de Apis mellifera: busca de novos genes e redes funcionais no contexto do desenvolvimento, da diferenciação de castas e da reprodução, AP.TEM
• Assunto(s): Biologia computacional Redes complexas Genética Teoria dos grafos Biologia do desenvolvimento Reconhecimento de padrões

Resumo

A computação e a bioinformática têm desempenhado papéis fundamentais na modelagem de sistemas biológicos, tais como determinação do sexo e castas em insetos sociais, em termos de teoria dos grafos e redes complexas, que fornecem informações importantes para a compreensão de mecanismos genético-moleculares envolvidos na formação de fenótipos (órgãos reprodutores, comportamento), que podem ser determinados por fatores genéticos (genes de determinação do sexo) ou ambientais (dieta diferenciada determina casta). Objetiva-se criar redes regulatórias homólogas entre 3 diferentes espécies de insetos (Apis mellifera, Drosophila melanogaster, Anopheles gambiae), que estejam relacionadas com a formação de fenótipos sexuais e redes regulatórias homólogas entre as 2 castas (rainha e operária) em abelhas. Diversas medidas destas redes, assim como métodos de reconhecimento de padrões e teoria dos grafos, serão utilizados para caracterizar e classificar as redes biológicas que possam ser utilizados para estudar as redes regulatórias em outros processos biológicos em vários organismos. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

COSTA, LUCIANO DA F.; RODRIGUES, FRANCISCO A.; CRISTINO, ALEXANDRE S. Complex networks: The key to systems biology. GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY, v. 31, n. 3, p. 591-601, 2008. Citações Web of Science: 28.