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Redes complexas aplicadas à genética e à biologia do desenvolvimento

Processo: 06/61232-2
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Data de Início da vigência: 01 de junho de 2007
Data de Término da vigência: 31 de maio de 2009
Área de conhecimento:Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação - Metodologia e Técnicas da Computação
Pesquisador responsável:Luciano da Fontoura Costa
Beneficiário:Alexandre dos Santos Cristino
Instituição Sede: Instituto de Física de São Carlos (IFSC). Universidade de São Paulo (USP). São Carlos , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:05/03926-5 - Genômica funcional de Apis mellifera: busca de novos genes e redes funcionais no contexto do desenvolvimento, da diferenciação de castas e da reprodução, AP.TEM
Assunto(s):Biologia computacional   Redes complexas   Genética   Teoria dos grafos   Biologia do desenvolvimento   Reconhecimento de padrões
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Bioinformatica | Biologia Do Desenvolvimento | Genetica | Reconhecimento De Padroes | Redes Complexas | Teoria Dos Grafos

Resumo

A computação e a bioinformática têm desempenhado papéis fundamentais na modelagem de sistemas biológicos, tais como determinação do sexo e castas em insetos sociais, em termos de teoria dos grafos e redes complexas, que fornecem informações importantes para a compreensão de mecanismos genético-moleculares envolvidos na formação de fenótipos (órgãos reprodutores, comportamento), que podem ser determinados por fatores genéticos (genes de determinação do sexo) ou ambientais (dieta diferenciada determina casta). Objetiva-se criar redes regulatórias homólogas entre 3 diferentes espécies de insetos (Apis mellifera, Drosophila melanogaster, Anopheles gambiae), que estejam relacionadas com a formação de fenótipos sexuais e redes regulatórias homólogas entre as 2 castas (rainha e operária) em abelhas. Diversas medidas destas redes, assim como métodos de reconhecimento de padrões e teoria dos grafos, serão utilizados para caracterizar e classificar as redes biológicas que possam ser utilizados para estudar as redes regulatórias em outros processos biológicos em vários organismos. (AU)

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
LUCIANO DA F. COSTA; FRANCISCO A. RODRIGUES; ALEXANDRE S. CRISTINO. Complex networks: the key to systems biology. GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY, v. 31, n. 3, p. 591-601, . (05/00587-5, 06/61232-2, 07/50633-9)
CRISTINO, ALEXANDRE S.; ANDRADE, ROBERTO F. S.; COSTA, LUCIANO DA F.; FORTUNATO, S; MANGIONI, G; MENEZES, R; NICOSIA, V. Detecting and Characterizing the Modular Structure of the Yeast Transcription Network. CONSTRUCTIVE NEURAL NETWORKS, v. 207, p. 4-pg., . (06/61232-2, 05/00587-5)