Caracterizacao de sequencias repetitivas do genoma nuclear de (trypanosoma cruzi) (clone cl brener).

• Processo: 00/11378-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de janeiro de 2001
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2001
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: José Franco da Silveira Filho
• Beneficiário: Renata Torres de Souza
• Instituição Sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Recombinação genética Sequências repetitivas de ácido nucleico Projeto genoma Trypanosoma cruzi
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Dna Repetitivo | Mapas Fisico E Genetico | Projeto Genoma | Recombinacao Genetica | Trypanosoma Cruzi

Resumo

Dando continuidade ao projeto de IC, nós pretendemos neste projeto caracterizar com detalhes as seqüências IGRE (InterGenie Repeated Element) e seqüências repetidas em tandem (clones F5.1 e F5.65) visando obter informações que possam a vir esclarecer o papel funcional destes elementos no genoma. Por outro lado, o mapeamento detalhado das seqüências repetidas vai ser de grande utilidade para o projeto de seqüenciamento do genoma do T. cruzi. Os objetivos específicos do projeto são: 1. Organização dos elementos IGRE e clones F5.1 e F5.65 no genoma do clone CL Brener: a) Mapeamento destes elementos nas bandas cromossômicas separadas por eletroforese de campo pulsado. b) Análise dos perfis de restrição do DNA genômico de T. cruzi hibridizado com sondas derivadas dos clones IGRE, F5.1 e F5.65 c) Determinação do número de cópias dos elementos repetidos através de "dot blot" quantitativo 2. Isolamento de fragmentos genômicos contendo cópias completas de elementos IGRE e dos clones F5.1 e F5.65 3. Análise da transcrição dos elementos repetidos através de hibridização com mRNAs em "northem blots" e produtos de RT/PCR (amplificação por PCR em cDNA simples fita sintetizado pela transcriptase reversa). (AU)