Desenvolvimento e Montagem de um Banco Virtual de Alérgenos, com Ênfase na Modelagem Molecular e Predição de Imunogenicidade

• Processo: 08/08502-7
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de fevereiro de 2009
• Data de Término da vigência: 31 de janeiro de 2012
• Área de conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
• Pesquisador responsável: Fabio Fernandes Morato Castro
• Beneficiário: Helen Andrade Arcuri
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina (FM). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Modelagem molecular
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: banco de dados biológicos | Bioinformática Estrutural aplicada ao estudo de alérgenos | Bioinformática Estrutural aplicada ao estudo de reconhecimento de epitopos | Classificação de Alérgenos | Modelagem molecular | Predição de Imunogenicidade | Alergia e Imunopatologia

Resumo

As alergias constituem um problema grave de saúde, com a incidência de casos reportados aumentando progressivamente. Estima-se que em torno de 15% a 25% das pessoas sofrem de alguma forma de alergia, levando-a assim a figurar entre as principais causas de enfermidades e problemas de saúde pública no mundo todo. O número de alérgenos caracterizados e informações relacionadas estão aumentando rapidamente, fazendo com que seja necessário o desenvolvimento de técnicas mais sofisticadas para o armazenamento, recuperação e análise destes dados. A bioinformática surge como um campo inovador nesta área, com ferramentas úteis para gerenciar, armazenar e analisar as informações sobre estes alérgenos e no desenvolvimento de aplicações específicas como algoritmos para identificação de epitopos, predição da alergenicidade, predição da reatividade cruzada, caracterização estrutural e funcional, reconhecimento de motivos alergênicos, agrupamento quanto ao tipo de família, entre outros. Diversos grupos de pesquisa em todo mundo vêm trabalhando no estudo sobre alérgenos com o intuito de desenvolver vacinas e terapias mais eficazes para as doenças alergênicas, com isso a quantidade de informações disponíveis na web cresceu exponencialmente gerando informações dispersas e redundantes, sendo necessário consultar diversas fontes para obter informações sobre os alérgenos, o que acarreta uma demora para encontrar uma determinada informação sobre um alérgeno especifico ao qual necessitamos de mais informação. Este projeto de Pós Doc tem como objetivo geral à construção de um cluster Beowulf para o desenvolvimento e integração de ferramentas de bioinformática aplicadas ao estudo de alérgenos disponibilizando estas informações através de um banco de dados curado público. O objetivo principal criarmos um web server onde iremos concentrar o maior número possível de informações sobre os alérgenos eliminado o problema de informações dispersas e redundantes, melhorar as ferramentas já existentes para identificar de forma mais eficaz o potencial de alergenicidade em novas proteínas modificadas geneticamente (transgênicos ou mutagênese) e seu potencial em gerar reatividade cruzada e desenvolver novas ferramentas para executar de forma eficiente o screening virtual possibilitando assim verificar a interação entre anticorpo e antígeno contribuindo para uma melhor compreensão do processo de sensibilização dos alérgenos em indivíduos sensíveis, os avanços obtidos nestes estudos da sensibilização e da caracterização destes alérgenos podem contribuir no desenvolvendo de vacinas mais eficazes no tratamento das alergias utilizando metodologias bem sedimentadas como as usadas para verificar interação entre proteína-ligante, por exemplo do modelo chave-fechadura.