Construção de um banco de dados de fatores de transcrição humanos

• Processo: 07/08443-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de fevereiro de 2008
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2008
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação - Metodologia e Técnicas da Computação
• Pesquisador responsável: Ney Lemke
• Beneficiário: Luiz Augusto Bovolenta
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IBB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
• Assunto(s): Banco de dados Fatores de transcrição
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Banco de dados | fatores de transcrição | Banco de Dados em Bioinformática

Resumo

Fatores de transcrição são proteínas que se ligam a seqüências nucleotídicas específicas situadas à montante das regiões promotoras de genes e, através dessa ligação, regulam positivamente ou negativamente a transcrição dos genes. Devido a essa função reguladora, a identificação e a caracterização dos fatores de transcrição são importantes para a compreensão de processos biológicos determinantes, como diferenciação celular e apoptose. As informações sobre os fatores de transcrição em humanos, particularmente quais os genes que tais fatores regulam, são encontrados de forma esparsa na literatura ou com disponibilidade limitada em banco de dados pagos. Portanto, é necessária a construção de um banco de dados que centralize as informações sobre os fatores de transcrição e cujos acesso e aquisição dos dados sejam gratuitos. No presente projeto, propomos a construção de um banco de dados de fatores de transcrição humanos gratuito contendo as seguintes informações para cada fator de transcrição: seqüências nucleotídicas de ligação do fator de transcrição, seus genes regulados e as referências nas quais encontra-se a prova experimental de tal regulação. Tal banco de dados será disponibilizado gratuitamente através de uma interface web.