Estudo da técnica de metagenômica para análise de fitopatógenos não cultivados

• Processo: 08/03145-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Novas Fronteiras
• Data de Início da vigência: 29 de outubro de 2008
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2009
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia - Fitossanidade
• Pesquisador responsável: Alexandre Morais Do Amaral
• Beneficiário: Alexandre Morais Do Amaral
• Pesquisador Anfitrião: Jo Handelsman
• Instituição Sede: Instituto Agronômico (IAC). Agência Paulista de Tecnologia dos Agronegócios (APTA). Secretaria de Agricultura e Abastecimento (São Paulo - Estado). Campinas , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: University of Wisconsin-Madison (UW-Madison), Estados Unidos
• Assunto(s): Biologia molecular vegetal Greening (doença de planta) Genômica Citricultura Suco de laranja
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Genomica | Greening | Huanglongbing | Biologia Molecular

Resumo

A citricultura se destaca como uma das mais importantes atividades do agronegócio brasileiro, sendo o Estado de São Paulo o maior produtor de citros e o maior exportador de suco de laranja concentrado congelado em escala mundial. A baixa produtividade brasileira (média de 2 caixas/planta/ano) está estritamente associada à expansão simultânea de pragas e doenças, com significativo reflexo nos custos de produção, ao fato de grande parte dessa produção ser conduzida em áreas não irrigadas e à estreita base genética utilizada. Nos últimos vinte anos várias doenças e pragas de importância econômica têm sido relatadas no Brasil, entre elas a CVC (clorose variegada dos citros), a leprose, a pinta preta, a mancha de alternaria, a morte súbita, o bicho furão, a minadora, cochonilhas, etc. Até então não havia sido relatada a ocorrência do huanglongbing (HLB, ex-greening), considerada uma das principais doenças dos citros em todo o mundo. Em 2004, a bactéria causadora dessa doença, Candidatus Liberibacter spp, foi detectada no Brasil, no Estado de São Paulo. O HLB é uma das mais severas e destrutivas doenças de citros, com prejuízos no desenvolvimento da planta (clorose, queda de folhas, redução de crescimento e de sistema radicular) e na produção de frutos (deformação, aborto de sementes, queda acentuada e redução de crescimento). A bactéria causadora não é cultivada em meio de cultivo, multiplica-se nos vasos do floema e é transmitida pela Diaphorina citri, um psilídeo comum nos pomares. Esta proposta visa aumentar a base de conhecimento da bactéria através da identificação de novas seqüências genéticas utilizando-se da técnica de metagenômica, que significa a caracterização genômica parcial de um organismo não-isolado. No caso desta bactéria, curiosamente os registros de genes depositados nas bases públicas de informação representam menos de uma dezena de genes. A identificação de mais genes poderia contribuir enormemente para o melhor conhecimento da biologia deste organismo assim como sugerir novos alvos para procedimentos de interesse agronômico, como durante o diagnóstico. Essa proposta de trabalho é parte integrante de Projeto Temático da FAPESP e representa esforço multidisciplinar que envolve equipes de vários grupos de pesquisa e desenvolvimento no Estado de São Paulo. Esta proposta de "projeto novas fronteiras" visa permitir o treinamento de pesquisador participante de projeto já financiado pela FAPESP em laboratório na Universidade do Estado de Wisconsin (Dr. Jo Handelsman), reconhecidamente identificado como referência no uso da técnica de metagenômica e propõe o refinamento da técnica para uso no Brasil. (AU)