Análise de interações entre proteínas no fitopatógeno Xanthomonas axonopodis pv. citri

• Processo: 01/05314-6
• Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Vigência (Início): 01 de agosto de 2001
• Vigência (Término): 31 de julho de 2005
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Shaker Chuck Farah
• Beneficiário: Cássia Docena
• Instituição-sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Genômica Xanthomonas axonopodis

Resumo

O objetivo deste projeto de doutorado é a investigação de interações proteína-proteína no fitopatógeno Xanthomonas axonopodis pv citri, através da técnica do duplo-híbrido, utilizando leveduras. Estamos particularmente interessadas em ORFs, identificadas nesta bactéria, com homologias à proteínas hipotéticas de Xylella fastidiosa e em proteínas quinases com especificidade desconhecida. A identificação das interações protéicas dessas ORFs pode ser de grande importância nas interações entre proteínas que dão especificidade a colonização bacteriana em Citrus. Proteínas quinases podem ser importantes em processos de transdução de sinal que levam a bactéria a colonizar o hospedeiro. O genoma de X. a. pv citri foi recentemente seqüenciado e as ORFs dos genes que codificam as proteínas mencionadas serão selecionadas in silico a partir de clones gerados para o seqüenciamento da bactéria. Bibliotecas de duplo-híbrido serão geradas a partir desses clones oriundos do seqüenciamento e de DNA genômico nebulizado aleatoriamente. A seleção das interações será realizada a partir de cruzamentos das duas bibliotecas. No decorrer do projeto, cruzaremos essas informações com projetos paralelos, já em andamento, de genômica funcional. Vale ressaltar ainda que este projeto é parte integrante do Projeto Temático de Genoma Funcional: "Identificação e análise Funcional e Estrutural das Interações Proteína-Proteína no Fitopatógeno Xanthomonas axonopodis pv citri". (AU)