Estudo das variações na rigidez torcional do DNA induzido por alterações no potencial químico da água e seus efeitos na ligação de actinomicina D

• Processo: 98/11462-3
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de novembro de 1998
• Data de Término da vigência: 31 de outubro de 2002
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
• Pesquisador responsável: João Ruggiero Neto
• Beneficiário: Fátima Pereira de Souza
• Instituição Sede: Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas (IBILCE). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de São José do Rio Preto. São José do Rio Preto , SP, Brasil
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Alosterismo | Ciclizacao | Circularizacao | Dna | Flexibilidade | Interacao

Resumo

Este projeto propõe investigar o efeito de alterações do potencial químico da água no módulo de rigidez torcional do DNA, bem como o sinergismo entre estas duas variáveis no alosterismo observado no reconhecimento da actinomicina D ao DNA. Esta investigação será feita através de experimentos de ciclização de fragmentos de DNA e de circularização de plasmídios, ambos utilizando T4 DNA ligase, na presença e na ausência de co-solventes neutros adicionados para ajustar o potencial químico da água, sendo que a visualização do produto destas reações será feita por eletroforese. A proposta é determinar o módulo de rigidez torcional do DNA monitorando o fator de ciclização molar para fragmentos contendo entre 219 e 239pb e com extremos coesivos idênticos (EcoRI) preparados através de PCR. A realização destes experimentos na presença de actinomicina D permitirá investigar as origens do efeito alostérico induzido por alterações do potencial químico da água na ligação da actinomicina D ao DNA. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

DE SOUZA‚ F.P.; NETO‚ A.A.; FOSSEY‚ M.A.; NETO‚ J.R.. The effect of changes in the bulk dielectric constant on the DNA torsional properties. Biopolymers, v. 87, n. 4, p. 244-248, 2007. (98/11462-3)