Anotação e comparação dos genes encontratos em Xanthomonas citri com outros genomas e análise da expressão de genes do Genoma Xylella fastidiosa por técnica de DNA microarray

• Processo: 00/09792-7
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2000
• Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2002
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Ana Claudia Rasera da Silva
• Beneficiário: Leandro Marcio Moreira
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Biologia computacional Genômica comparativa Xanthomonas Xylella fastidiosa Genoma Xylella fastidiosa Genoma Xanthomonas Análise de sequência com séries de oligonucleotídeos
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Anotacao | Bioinformatica | Hipoteticas | Microarray | Xanthomonas | Xylella

Resumo

Utilizando ferramentas de bioinformática estaremos realizando a anotação das vias de metabolismo intermediário e de pequenas moléculas em Xanthomonas citri com o objetivo de compreendermos seu metabolismo como um todo e ao mesmo tempo inter-relacioná-la com Xylella fastidiosa, uma vez que são duas bactérias filogeneticamente próximas e por infectarem os citros. Já no que diz respeito á Xylella estaremos realizando análise de expressão gênica por técnica de DNA microarray com o propósito de sabermos em que condições Xylella expressa determinados proteínas e até mesmo determinar uma função a ORF's classificadas como hipotéticas por não apresentarem qualquer tipo de função putative. (AU)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

MOREIRA, Leandro Marcio. Análise comparativa entre os genomas dos fitopatógenos Xylella fastidiosa e Xanthomonas axonopodis pv. citri. 2002. Dissertação de Mestrado - Universidade de São Paulo (USP). Conjunto das Químicas (IQ e FCF) (CQ/DBDCQ) São Paulo.