Definicao "in silico" do transcriptoma de diferentes tipos de tumor.

• Processo: 00/02703-9
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2000
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2004
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Sandro José de Souza
• Beneficiário: Maarten Rudolph Leerkes
• Instituição Sede: Instituto Ludwig de Pesquisa sobre o Câncer (ILPC). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Genomas Etiquetas de sequências expressas Transcriptoma Neoplasias
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Est | Genoma | Transcriptoma | Tumor

Resumo

O presente projeto visa implementar modificações no programa ESSEMBLER e usar esta versão modificada na definição do transcriptoma de diferentes tipos tumorais e seus respectivos tecidos normais. Com estas informações, pretendemos identificar transcritos diferencialmente expressos. Acredita-se que a maioria dos genes humanos já esteja representando, pelo menos parcialmente, no banco de dados de "Expressed Sequence Tags", o chamado dbEST. Seqüências derivadas do projeto Genoma Humano do Câncer vêm contribuindo significativamente para a caracterização do transcriptoma humano. O presente projeto objetiva utilizar estes dados na tentativa de se caracterizar o transcriptoma do tecido mamário humano. Para tanto, haverá a necessidade de se implementar mudanças no programa ESSEMBLER (desenvolvido no nosso laboratório). Finalmente. O presente projeto também visa corporar o transcriptoma de diferentes tecidos tumorais com os seus equivalentes normais. (AU)