Estudo funcional e estrutural das proteínas que interagem com a proteína AUF-1 envolvidas na regulação da degradação de mRNAs

• Processo: 02/12515-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2003
• Data de Término da vigência: 29 de fevereiro de 2008
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Jörg Kobarg
• Beneficiário: Alexandre José Christino Quaresma
• Instituição Sede: Associação Brasileira de Tecnologia de Luz Síncrotron (ABTLuS). Ministério da Ciência, Tecnologia e Inovação (Brasil). Campinas , SP, Brasil
• Assunto(s): Degradação mitocondrial Mapeamento de interação de proteínas
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Degradacao De Mrna | Imp2 | Interacao Proteina Proteina | Nsap1

Resumo

Vários mRNAs que apresentam degradação rápida possuem motivos ricos em AU em suas regiões 3' não traduzíveis. Funcionalmente, os domínios ricos em AU parecem mediar a deadenilação e subseqüente clivagem do corpo do mRNA. AUF1 é uma proteína que atua nessa fase do controle da expressão gênica e se liga à nessas regiões 3' não traduzidas, sinalizando a degradação dos mesmos. Nossos estudos anteriores com AUF1 utilizando o sistema de duplo híbrido em leveduras identificaram três proteínas que interagem com AUF1. IMP-2 ("IGF-II mRNA binding protein 2"), NSAP1 ("Non structural associated protein 1") e NSEP-1 ("Nuclease sensitive element binding protein 1"). Esse projeto visa o estudo estrutural e funcional dos domínios RRMs ("RNA recongnition motif"), presentes na proteína humana NSAP1, e dos domínios KH ("K-homology"), presentes na proteína humana IMP-2 por técnicas espectroscópicas e de RMN (Ressonância magnética nuclear). Na parte funcional do projeto vamos utilizar o sistema de duplo híbrido em levedura nos será útil para determinar as proteínas que interagem com IMP-2 e com NSAP1. Outros experimentos funcionais in vitro como, por exemplo, "ensaios de gelshif" (EMSA) nos servirão para analisar as interações entre as proteínas e o RNA. Estudar a estrutura e função das proteínas NSAP1 e IMP-2 e analisar a especificidade e o modo das interações proteína-proteínas, e RNA-proteína faz são os objetivos centrais desse projeto. (AU)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

QUARESMA, Alexandre José Christino. Estudos funcionais e estruturais da proteina humana hnRNP Q/NSAP1. 2008. Tese de Doutorado - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de Biologia Campinas, SP.